31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2672 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2672  NLP/P60 protein  100 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.95108 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3535  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0987599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1243  NLP/P60 protein  56.41 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215255  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1892  hypothetical protein  32.82 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0738219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  64.29 
 
 		 381 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  47.5 
 
 		 501 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  44 
 
 		 392 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  48.89 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  48.89 
 
 		 432 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  53.12 
 
 		 374 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  48.48 
 
 		 400 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  31.5 
 
 		 337 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  42 
 
 		 162 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  44.68 
 
 		 361 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  59.38 
 
 		 235 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  44.68 
 
 		 361 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3653  NLP/P60 protein  28.93 
 
 		 232 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013969  normal  0.207873 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 348 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 378 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  44.68 
 
 		 363 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 348 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  44.68 
 
 		 363 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 348 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  39.22 
 
 		 279 aa  40.4  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  48.57 
 
 		 393 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  56.41 
 
 		 326 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  57.14 
 
 		 362 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  39.22 
 
 		 287 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  52.5 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>