22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1892 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1892  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0738219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2672  NLP/P60 protein  32.82 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.95108 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  31.78 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  37.1 
 
 		 392 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  28.3 
 
 		 217 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1640  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  26.12 
 
 		 326 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  26.35 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  28.7 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0997  NLP/P60 protein  39.24 
 
 		 669 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  27.82 
 
 		 450 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  32.43 
 
 		 337 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  29.17 
 
 		 177 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  29.17 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  32.79 
 
 		 400 aa  42  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  25.64 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  32.41 
 
 		 236 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1300  NLP/P60 protein  28.36 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  26.28 
 
 		 201 aa  40.8  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  32.26 
 
 		 366 aa  40.8  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 347 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3535  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0987599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>