92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0351 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4338    88.64 
 
 		 619 bp  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    100 
 
 		 1142 bp  2264    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  100 
 
 		 837 bp  1653    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1289    88.34 
 
 		 858 bp  908    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4717    86.13 
 
 		 821 bp  718    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3677    87.64 
 
 		 728 bp  690    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4219    88.76 
 
 		 839 bp  896    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  89.22 
 
 		 837 bp  910    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  89.1 
 
 		 837 bp  902    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  97.08 
 
 		 753 bp  1318    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  87.17 
 
 		 756 bp  726    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  98.23 
 
 		 282 bp  519  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  83.93 
 
 		 753 bp  517  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0441  putative insertion element protein  91.54 
 
 		 336 bp  434  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  91.84 
 
 		 282 bp  377  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1487    91.97 
 
 		 1604 bp  369  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1488    91.94 
 
 		 273 bp  367  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5442    98.94 
 
 		 189 bp  359  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  90.78 
 
 		 282 bp  353  7e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  90.78 
 
 		 282 bp  353  7e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3380    90.32 
 
 		 279 bp  339  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3676    90.11 
 
 		 283 bp  331  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.759486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1290    90.11 
 
 		 283 bp  331  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8384  hypothetical protein  90.18 
 
 		 405 bp  331  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  90.37 
 
 		 282 bp  329  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4225    95 
 
 		 189 bp  285  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5443    100 
 
 		 123 bp  244  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  85.2 
 
 		 282 bp  224  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  84.48 
 
 		 282 bp  208  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4342    86.67 
 
 		 225 bp  208  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0170    87.26 
 
 		 249 bp  206  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0366514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4224    95 
 
 		 120 bp  190  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0104    87.77 
 
 		 204 bp  190  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3972    90.67 
 
 		 150 bp  186  9.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0535  hypothetical protein  92.8 
 
 		 309 bp  176  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3971    92.68 
 
 		 123 bp  172  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4831    91.87 
 
 		 123 bp  165  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1507    91.27 
 
 		 126 bp  163  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1038    85.56 
 
 		 183 bp  151  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0151  hypothetical protein  85.56 
 
 		 216 bp  151  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4718    88.97 
 
 		 384 bp  151  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0107  hypothetical protein  85.56 
 
 		 216 bp  151  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0226  hypothetical protein  84.08 
 
 		 351 bp  145  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1130    85 
 
 		 183 bp  143  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0567    87.7 
 
 		 129 bp  123  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0568    85.4 
 
 		 159 bp  113  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0794854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1091    85.4 
 
 		 150 bp  113  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0797  hypothetical protein  85.94 
 
 		 162 bp  111  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0461181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1092    86.07 
 
 		 129 bp  107  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.870086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1508    85.38 
 
 		 204 bp  107  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1039    85.16 
 
 		 129 bp  103  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1131    85.25 
 
 		 129 bp  99.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4009    81.92 
 
 		 180 bp  97.6  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.223368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  84.68 
 
 		 831 bp  95.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1029    93.44 
 
 		 279 bp  89.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2815    85.32 
 
 		 240 bp  89.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1968    82.98 
 
 		 162 bp  89.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4830    83.22 
 
 		 167 bp  85.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3515  hypothetical protein  100 
 
 		 216 bp  67.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 321 bp  60  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  90.91 
 
 		 276 bp  56  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4221    87.5 
 
 		 105 bp  56  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  88 
 
 		 525 bp  52  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  94.12 
 
 		 870 bp  52  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  88 
 
 		 525 bp  52  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  96.67 
 
 		 300 bp  52  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  96.67 
 
 		 300 bp  52  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  96.67 
 
 		 276 bp  52  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  88 
 
 		 723 bp  52  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  96.67 
 
 		 276 bp  52  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  94.12 
 
 		 870 bp  52  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  96.67 
 
 		 276 bp  52  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  96.67 
 
 		 276 bp  52  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  88 
 
 		 723 bp  52  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  88 
 
 		 723 bp  52  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  96.67 
 
 		 276 bp  52  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  96.67 
 
 		 276 bp  52  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  96.55 
 
 		 870 bp  50.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  96.55 
 
 		 930 bp  50.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3976    80.34 
 
 		 171 bp  50.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  96.55 
 
 		 870 bp  50.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  96.55 
 
 		 870 bp  50.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2015    96.55 
 
 		 929 bp  50.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0494  hypothetical protein  83.12 
 
 		 192 bp  50.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  90.24 
 
 		 279 bp  50.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  90.24 
 
 		 285 bp  50.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  90.24 
 
 		 279 bp  50.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  90.24 
 
 		 279 bp  50.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  90.24 
 
 		 279 bp  50.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  93.94 
 
 		 855 bp  50.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1159    93.94 
 
 		 312 bp  50.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3056  putative transcriptional regulator  91.67 
 
 		 300 bp  48.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.132705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>