29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4831 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4831    100 
 
 
123 bp  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  96.75 
 
 
282 bp  212  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0535  hypothetical protein  95.93 
 
 
309 bp  204  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  95.12 
 
 
282 bp  196  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  95.12 
 
 
282 bp  196  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1290    94.31 
 
 
283 bp  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3380    94.31 
 
 
279 bp  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3676    94.31 
 
 
283 bp  188  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.759486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1507    94.31 
 
 
126 bp  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3971    92.68 
 
 
123 bp  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  91.87 
 
 
282 bp  165  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5443    91.87 
 
 
123 bp  165  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    91.87 
 
 
1142 bp  165  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4224    91.67 
 
 
120 bp  159  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1488    91.06 
 
 
273 bp  157  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1487    91.06 
 
 
1604 bp  157  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4718    90.24 
 
 
384 bp  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391883  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0567    90.52 
 
 
129 bp  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771023  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  89.83 
 
 
282 bp  139  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  90.35 
 
 
282 bp  139  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1039    86.89 
 
 
129 bp  115  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0797  hypothetical protein  84.43 
 
 
162 bp  91.7  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0461181  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1092    83.9 
 
 
129 bp  83.8  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.870086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1131    83.05 
 
 
129 bp  75.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  83.05 
 
 
282 bp  75.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1968    87.88 
 
 
162 bp  67.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367086  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0494  hypothetical protein  84.42 
 
 
192 bp  58  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217907  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0107  hypothetical protein  100 
 
 
216 bp  56  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0151  hypothetical protein  100 
 
 
216 bp  56  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>