46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3380 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3380    100 
 
 		 279 bp  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  99.64 
 
 		 282 bp  545  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  98.92 
 
 		 282 bp  529  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  92.83 
 
 		 282 bp  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3676    92.5 
 
 		 283 bp  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.759486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1290    92.14 
 
 		 283 bp  373  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1487    91.97 
 
 		 1604 bp  369  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1488    91.94 
 
 		 273 bp  367  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  91.4 
 
 		 282 bp  363  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    90.32 
 
 		 1142 bp  339  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  90 
 
 		 282 bp  321  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  86.5 
 
 		 282 bp  250  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  85.4 
 
 		 282 bp  226  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0535  hypothetical protein  95.35 
 
 		 309 bp  208  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1507    95.2 
 
 		 126 bp  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4831    94.31 
 
 		 123 bp  188  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3971    92.68 
 
 		 123 bp  172  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4224    92.5 
 
 		 120 bp  167  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0567    92.37 
 
 		 129 bp  163  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5443    91.06 
 
 		 123 bp  157  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4718    88.97 
 
 		 384 bp  151  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1039    88.52 
 
 		 129 bp  131  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0797  hypothetical protein  87.7 
 
 		 162 bp  123  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0461181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1092    86.67 
 
 		 129 bp  111  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.870086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1131    85.83 
 
 		 129 bp  103  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1968    82.67 
 
 		 162 bp  91.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4221    86.73 
 
 		 105 bp  91.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1029    97.73 
 
 		 279 bp  79.8  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  88.14 
 
 		 279 bp  61.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  88.14 
 
 		 285 bp  61.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  88.14 
 
 		 279 bp  61.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  88.14 
 
 		 279 bp  61.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  88.14 
 
 		 279 bp  61.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0151  hypothetical protein  100 
 
 		 216 bp  60  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0107  hypothetical protein  100 
 
 		 216 bp  60  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  58  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  58  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  58  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  58  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  58  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  58  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0494  hypothetical protein  84.42 
 
 		 192 bp  58  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3515  hypothetical protein  96.88 
 
 		 216 bp  56  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  90.7 
 
 		 276 bp  54  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  96.55 
 
 		 321 bp  50.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  96.3 
 
 		 279 bp  46.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>