43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1290 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1290    100 
 
 		 283 bp  561  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  92.58 
 
 		 282 bp  387  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  92.58 
 
 		 282 bp  387  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3380    92.14 
 
 		 279 bp  373  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  91.85 
 
 		 282 bp  353  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3676    91.2 
 
 		 283 bp  349  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.759486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  90.46 
 
 		 282 bp  339  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1487    91.29 
 
 		 1604 bp  333  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1488    91.29 
 
 		 273 bp  333  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    90.11 
 
 		 1142 bp  331  6e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  90.11 
 
 		 282 bp  331  6e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  85.25 
 
 		 282 bp  218  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1507    95.24 
 
 		 126 bp  202  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0535  hypothetical protein  95.2 
 
 		 309 bp  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  84.47 
 
 		 282 bp  190  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4831    94.31 
 
 		 123 bp  188  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3971    92.68 
 
 		 123 bp  172  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5443    92.68 
 
 		 123 bp  172  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4718    90.44 
 
 		 384 bp  167  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4224    90.83 
 
 		 120 bp  151  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0567    90.16 
 
 		 129 bp  147  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1039    86.72 
 
 		 129 bp  119  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1968    87.16 
 
 		 162 bp  105  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1029    85.82 
 
 		 279 bp  101  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1092    86.11 
 
 		 129 bp  95.6  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.870086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0797  hypothetical protein  84.38 
 
 		 162 bp  95.6  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0461181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4221    88.89 
 
 		 105 bp  91.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1131    85.19 
 
 		 129 bp  87.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  93.02 
 
 		 276 bp  61.9  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  58  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  58  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  58  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  58  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  58  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3515  hypothetical protein  96.97 
 
 		 216 bp  58  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  58  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0151  hypothetical protein  96.88 
 
 		 216 bp  56  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0107  hypothetical protein  96.88 
 
 		 216 bp  56  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0494  hypothetical protein  83.12 
 
 		 192 bp  50.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  96.55 
 
 		 321 bp  50.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1213  hypothetical protein  90 
 
 		 258 bp  48.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0796796  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  89.74 
 
 		 279 bp  46.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 531 bp  46.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>