31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1507 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1507    100 
 
 		 126 bp  250  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0535  hypothetical protein  96.8 
 
 		 309 bp  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  96 
 
 		 282 bp  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  96 
 
 		 282 bp  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1290    95.24 
 
 		 283 bp  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  95.24 
 
 		 282 bp  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3380    95.2 
 
 		 279 bp  200  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4831    94.31 
 
 		 123 bp  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3676    93.65 
 
 		 283 bp  186  9e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.759486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  92.86 
 
 		 282 bp  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3971    92.68 
 
 		 123 bp  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1487    92 
 
 		 1604 bp  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1488    92 
 
 		 273 bp  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4224    92.5 
 
 		 120 bp  167  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4718    91.27 
 
 		 384 bp  163  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    91.27 
 
 		 1142 bp  163  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0567    91.6 
 
 		 129 bp  157  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5443    91.06 
 
 		 123 bp  157  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  91.45 
 
 		 282 bp  153  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  90.08 
 
 		 282 bp  145  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1039    86.89 
 
 		 129 bp  115  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0797  hypothetical protein  84.43 
 
 		 162 bp  91.7  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0461181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1092    84.3 
 
 		 129 bp  89.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.870086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1131    83.47 
 
 		 129 bp  81.8  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  83.47 
 
 		 282 bp  81.8  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1968    82.73 
 
 		 162 bp  67.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0151  hypothetical protein  96.77 
 
 		 216 bp  54  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0107  hypothetical protein  96.77 
 
 		 216 bp  54  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4198  pyruvate carboxylase  90.24 
 
 		 3447 bp  50.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.721945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0959  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 		 3120 bp  48.1  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.524193  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2165  pyruvate carboxylase  90 
 
 		 3438 bp  48.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>