37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3676 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3676    100 
 
 		 283 bp  561  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.759486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  92.93 
 
 		 282 bp  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  92.93 
 
 		 282 bp  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3380    92.5 
 
 		 279 bp  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1290    91.2 
 
 		 283 bp  349  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  90.81 
 
 		 282 bp  347  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1487    90.91 
 
 		 1604 bp  339  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  90.46 
 
 		 282 bp  339  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1488    90.88 
 
 		 273 bp  337  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    90.11 
 
 		 1142 bp  331  6e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  88.56 
 
 		 282 bp  283  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  84.89 
 
 		 282 bp  210  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  84.53 
 
 		 282 bp  202  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0535  hypothetical protein  95.2 
 
 		 309 bp  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4831    94.31 
 
 		 123 bp  188  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1507    93.65 
 
 		 126 bp  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3971    93.5 
 
 		 123 bp  180  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5443    92.68 
 
 		 123 bp  172  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4224    92.5 
 
 		 120 bp  167  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0567    91.74 
 
 		 129 bp  161  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4718    89.06 
 
 		 384 bp  143  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4221    90.82 
 
 		 105 bp  123  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1039    86.05 
 
 		 129 bp  113  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0797  hypothetical protein  85.27 
 
 		 162 bp  105  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0461181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1092    85.25 
 
 		 129 bp  99.6  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.870086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1131    84.43 
 
 		 129 bp  91.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1968    82.96 
 
 		 162 bp  85.7  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1029    95.12 
 
 		 279 bp  65.9  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0151  hypothetical protein  100 
 
 		 216 bp  63.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0107  hypothetical protein  100 
 
 		 216 bp  63.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1213  hypothetical protein  90.7 
 
 		 258 bp  54  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0796796  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  96.67 
 
 		 276 bp  52  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  96.67 
 
 		 276 bp  52  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  96.67 
 
 		 276 bp  52  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  96.67 
 
 		 276 bp  52  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  96.67 
 
 		 276 bp  52  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  96.67 
 
 		 276 bp  52  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>