45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4718 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4718    100 
 
 		 384 bp  761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  91.18 
 
 		 282 bp  174  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0535  hypothetical protein  91.67 
 
 		 309 bp  174  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  90.51 
 
 		 282 bp  168  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1290    90.44 
 
 		 283 bp  167  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1507    91.27 
 
 		 126 bp  163  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  89.71 
 
 		 282 bp  159  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  89.71 
 
 		 282 bp  159  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3380    88.97 
 
 		 279 bp  151  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    88.97 
 
 		 1142 bp  151  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  88.97 
 
 		 282 bp  151  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4831    90.24 
 
 		 123 bp  149  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1487    88.81 
 
 		 1604 bp  147  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1488    88.72 
 
 		 273 bp  145  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3676    89.06 
 
 		 283 bp  143  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.759486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4224    89.17 
 
 		 120 bp  135  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  88.71 
 
 		 282 bp  135  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5443    88.62 
 
 		 123 bp  133  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3971    88.62 
 
 		 123 bp  133  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0567    87.7 
 
 		 129 bp  123  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0999  hypothetical protein  98.25 
 
 		 228 bp  105  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1039    90.36 
 
 		 129 bp  101  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6426  hypothetical protein  94.92 
 
 		 360 bp  93.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3999  hypothetical protein  96.08 
 
 		 2001 bp  85.7  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.954814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4221    86.52 
 
 		 105 bp  81.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0797  hypothetical protein  86.75 
 
 		 162 bp  77.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0461181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  86.21 
 
 		 282 bp  77.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1092    82.79 
 
 		 129 bp  75.8  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.870086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1131    81.97 
 
 		 129 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  87.93 
 
 		 279 bp  60  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  87.93 
 
 		 285 bp  60  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  87.93 
 
 		 279 bp  60  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  87.93 
 
 		 279 bp  60  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  87.93 
 
 		 279 bp  60  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  91.84 
 
 		 1371 bp  58  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0151  hypothetical protein  96.77 
 
 		 216 bp  54  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0107  hypothetical protein  96.77 
 
 		 216 bp  54  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  85.48 
 
 		 276 bp  52  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3119  hypothetical protein  85.48 
 
 		 120 bp  52  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.605614  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6139  transposase IS3/IS911 family protein  96.55 
 
 		 264 bp  50.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.623502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1968    83.33 
 
 		 162 bp  48.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1114  ISRSO16-transposase OrfA protein  96.3 
 
 		 312 bp  46.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  84.13 
 
 		 279 bp  46.1  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2882  hypothetical protein  96.3 
 
 		 300 bp  46.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663087  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2730  isrso12-transposase orfa  96.3 
 
 		 312 bp  46.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>