29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1131 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1131    100 
 
 		 129 bp  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 282 bp  252  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1092    99.22 
 
 		 129 bp  248  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.870086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0797  hypothetical protein  94.21 
 
 		 162 bp  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0461181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1039    92.62 
 
 		 129 bp  170  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0494  hypothetical protein  97.47 
 
 		 192 bp  141  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  87.4 
 
 		 282 bp  125  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  86.07 
 
 		 282 bp  107  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3380    85.83 
 
 		 279 bp  103  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  85.25 
 
 		 282 bp  99.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4224    85.96 
 
 		 120 bp  99.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    85.25 
 
 		 1142 bp  99.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  85 
 
 		 282 bp  95.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  85 
 
 		 282 bp  95.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1488    85.85 
 
 		 273 bp  91.7  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1487    85.85 
 
 		 1604 bp  91.7  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5443    84.75 
 
 		 123 bp  91.7  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3676    84.43 
 
 		 283 bp  91.7  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.759486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3971    84.62 
 
 		 123 bp  89.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0567    85.19 
 
 		 129 bp  87.7  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1290    85.19 
 
 		 283 bp  87.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0535  hypothetical protein  84.17 
 
 		 309 bp  87.7  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1507    83.47 
 
 		 126 bp  81.8  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  82.68 
 
 		 282 bp  77.8  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4831    83.05 
 
 		 123 bp  75.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4718    81.97 
 
 		 384 bp  67.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0151  hypothetical protein  94.12 
 
 		 216 bp  52  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0107  hypothetical protein  94.12 
 
 		 216 bp  52  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1968    85.96 
 
 		 162 bp  50.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>