29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4224 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4224    100 
 
 		 120 bp  238  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  96.67 
 
 		 282 bp  206  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    95 
 
 		 1142 bp  190  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5443    95 
 
 		 123 bp  190  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  93.33 
 
 		 282 bp  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3971    93.33 
 
 		 123 bp  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  93.33 
 
 		 282 bp  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1507    92.5 
 
 		 126 bp  167  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3380    92.5 
 
 		 279 bp  167  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  92.5 
 
 		 282 bp  167  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3676    92.5 
 
 		 283 bp  167  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.759486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1487    94.44 
 
 		 1604 bp  167  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1488    94.44 
 
 		 273 bp  167  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0535  hypothetical protein  92.5 
 
 		 309 bp  167  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4831    91.67 
 
 		 123 bp  159  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1290    90.83 
 
 		 283 bp  151  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4718    89.17 
 
 		 384 bp  135  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0797  hypothetical protein  89.17 
 
 		 162 bp  135  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0461181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  89.81 
 
 		 282 bp  127  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1039    87.72 
 
 		 129 bp  115  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  87.72 
 
 		 282 bp  115  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0567    87.61 
 
 		 129 bp  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1092    86.84 
 
 		 129 bp  107  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.870086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1131    85.96 
 
 		 129 bp  99.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  85.96 
 
 		 282 bp  99.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1968    82.18 
 
 		 162 bp  58  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0494  hypothetical protein  84.21 
 
 		 192 bp  56  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0107  hypothetical protein  100 
 
 		 216 bp  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0151  hypothetical protein  100 
 
 		 216 bp  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>