29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3971 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3971    100 
 
 		 123 bp  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  93.5 
 
 		 282 bp  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0535  hypothetical protein  93.5 
 
 		 309 bp  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  93.5 
 
 		 282 bp  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  93.5 
 
 		 282 bp  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  93.5 
 
 		 282 bp  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3676    93.5 
 
 		 283 bp  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.759486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4224    93.33 
 
 		 120 bp  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3380    92.68 
 
 		 279 bp  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1507    92.68 
 
 		 126 bp  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1290    92.68 
 
 		 283 bp  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4831    92.68 
 
 		 123 bp  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5443    92.68 
 
 		 123 bp  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    92.68 
 
 		 1142 bp  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1487    90.99 
 
 		 1604 bp  141  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1488    90.99 
 
 		 273 bp  141  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  90.99 
 
 		 282 bp  141  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  89.74 
 
 		 282 bp  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4718    88.62 
 
 		 384 bp  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0567    88.79 
 
 		 129 bp  127  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0797  hypothetical protein  86.89 
 
 		 162 bp  115  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0461181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1039    87.07 
 
 		 129 bp  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1092    85.47 
 
 		 129 bp  97.6  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.870086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1968    91.3 
 
 		 162 bp  89.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1131    84.62 
 
 		 129 bp  89.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  84.62 
 
 		 282 bp  89.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0494  hypothetical protein  84.42 
 
 		 192 bp  58  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0107  hypothetical protein  100 
 
 		 216 bp  52  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0151  hypothetical protein  100 
 
 		 216 bp  52  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>