54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1487 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1487    100 
 
 		 1604 bp  3180    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1488    100 
 
 		 273 bp  541  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  93.07 
 
 		 282 bp  392  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  92.34 
 
 		 282 bp  377  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  92.34 
 
 		 282 bp  377  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3380    91.97 
 
 		 279 bp  369  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    91.97 
 
 		 1142 bp  369  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  91.24 
 
 		 282 bp  353  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3676    90.91 
 
 		 283 bp  339  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.759486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1290    91.29 
 
 		 283 bp  333  9e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0496  hypothetical protein  93.33 
 
 		 291 bp  305  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  89.8 
 
 		 282 bp  299  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5746  hypothetical protein  93.2 
 
 		 291 bp  297  5e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  85.87 
 
 		 282 bp  232  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  84.51 
 
 		 1254 bp  214  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  85.49 
 
 		 282 bp  212  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  83.28 
 
 		 1263 bp  192  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0535  hypothetical protein  92.25 
 
 		 309 bp  176  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1507    92 
 
 		 126 bp  168  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4224    94.44 
 
 		 120 bp  167  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5443    91.06 
 
 		 123 bp  157  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4831    91.06 
 
 		 123 bp  157  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4718    88.81 
 
 		 384 bp  147  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3971    90.99 
 
 		 123 bp  141  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0567    89.47 
 
 		 129 bp  131  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4221    88.54 
 
 		 105 bp  103  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1029    84.85 
 
 		 279 bp  103  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1039    85.25 
 
 		 129 bp  99.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1092    86.79 
 
 		 129 bp  99.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.870086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0797  hypothetical protein  85.45 
 
 		 162 bp  91.7  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0461181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1131    85.85 
 
 		 129 bp  91.7  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1968    85 
 
 		 162 bp  79.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1941  sodium/hydrogen exchanger  97.62 
 
 		 1269 bp  75.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  89.29 
 
 		 1254 bp  63.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  97.22 
 
 		 1242 bp  63.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  80.58 
 
 		 1257 bp  61.9  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0107  hypothetical protein  100 
 
 		 216 bp  58  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  58  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  58  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0151  hypothetical protein  100 
 
 		 216 bp  58  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  58  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  58  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  58  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  58  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  94.12 
 
 		 279 bp  52  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_003296  RS02127  transcriptional regulator transcription regulator protein  100 
 
 		 975 bp  50.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3515  hypothetical protein  96.55 
 
 		 216 bp  50.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  96.55 
 
 		 321 bp  50.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  89.8 
 
 		 1275 bp  50.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0023  diguanylate cyclase  100 
 
 		 1755 bp  50.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0108472 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  79.56 
 
 		 1257 bp  50.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3211  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 2514 bp  48.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13440  pyridoxamine 5-phosphate oxidase  93.75 
 
 		 738 bp  48.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  88.64 
 
 		 276 bp  48.1  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>