32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1029 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1029    100 
 
 		 279 bp  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1487    84.85 
 
 		 1604 bp  103  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1488    84.85 
 
 		 273 bp  103  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1290    85.82 
 
 		 283 bp  101  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  95.08 
 
 		 282 bp  97.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  81.52 
 
 		 282 bp  95.6  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  85.98 
 
 		 282 bp  93.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    93.44 
 
 		 1142 bp  89.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 282 bp  87.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  97.73 
 
 		 282 bp  79.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3380    97.73 
 
 		 279 bp  79.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  97.73 
 
 		 282 bp  79.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  95.56 
 
 		 282 bp  73.8  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  81.62 
 
 		 276 bp  71.9  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3676    95.12 
 
 		 283 bp  65.9  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.759486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  60  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  60  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  60  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  60  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  60  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 276 bp  60  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3515  hypothetical protein  97.06 
 
 		 216 bp  60  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  87.27 
 
 		 279 bp  54  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  87.27 
 
 		 285 bp  54  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  87.27 
 
 		 279 bp  54  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  87.27 
 
 		 279 bp  54  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  87.27 
 
 		 279 bp  54  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  96.67 
 
 		 321 bp  52  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4221    86.79 
 
 		 105 bp  50.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1213  hypothetical protein  90 
 
 		 258 bp  48.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0796796  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3119  hypothetical protein  83.82 
 
 		 120 bp  48.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.605614  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  89.74 
 
 		 279 bp  46.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>