22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2015 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2015    100 
 
 		 929 bp  1842    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  97.53 
 
 		 930 bp  1653    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3582    98.88 
 
 		 99 bp  168  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3522  hypothetical protein  86.96 
 
 		 525 bp  87.7  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585082 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1159    83.21 
 
 		 312 bp  85.7  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  83.21 
 
 		 855 bp  85.7  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1827  hypothetical protein  82.48 
 
 		 588 bp  81.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1829  hypothetical protein  89.86 
 
 		 825 bp  81.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3557  hypothetical protein  82.48 
 
 		 588 bp  81.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3559  hypothetical protein  89.86 
 
 		 525 bp  81.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3519  hypothetical protein  82.24 
 
 		 291 bp  61.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.696579 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0800  IstB ATP binding domain-containing protein  81.15 
 
 		 525 bp  60  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844919 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  80.29 
 
 		 849 bp  58  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1289    100 
 
 		 858 bp  58  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  85.29 
 
 		 861 bp  56  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4192    85.29 
 
 		 222 bp  56  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0441  putative insertion element protein  96.77 
 
 		 336 bp  54  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  96.77 
 
 		 753 bp  54  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02110  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  100 
 
 		 936 bp  52  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 837 bp  50.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    96.55 
 
 		 1142 bp  50.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3120    82.02 
 
 		 890 bp  50.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.269434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>