11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3582 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3582    100 
 
 		 99 bp  196  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  98.88 
 
 		 930 bp  168  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2015    98.88 
 
 		 929 bp  168  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1827  hypothetical protein  83.33 
 
 		 588 bp  63.9  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3557  hypothetical protein  83.33 
 
 		 588 bp  63.9  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0800  IstB ATP binding domain-containing protein  81.25 
 
 		 525 bp  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  86.27 
 
 		 870 bp  46.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  86.27 
 
 		 870 bp  46.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3120    80.61 
 
 		 890 bp  44.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  80.61 
 
 		 849 bp  44.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8384  hypothetical protein  93.33 
 
 		 405 bp  44.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>