More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0800 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0800  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844919 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 255 aa  176  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 255 aa  176  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 255 aa  176  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0708  IstB ATP binding domain-containing protein  72.13 
 
 		 221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1827  hypothetical protein  87.78 
 
 		 195 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3557  hypothetical protein  87.78 
 
 		 195 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  73.33 
 
 		 284 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  73.33 
 
 		 282 aa  135  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  73.33 
 
 		 286 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  71.11 
 
 		 283 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  77.5 
 
 		 289 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  77.5 
 
 		 289 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  77.5 
 
 		 289 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  77.5 
 
 		 289 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  77.5 
 
 		 289 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3519  hypothetical protein  93.94 
 
 		 96 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.696579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1009  transposase  71.25 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  56.99 
 
 		 252 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  56.99 
 
 		 252 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  56.99 
 
 		 252 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  56.99 
 
 		 252 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8384  hypothetical protein  58.16 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  50.39 
 
 		 309 aa  112  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  59.14 
 
 		 278 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  63.33 
 
 		 271 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  63.33 
 
 		 267 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  59.14 
 
 		 278 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  62.22 
 
 		 276 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  63.33 
 
 		 267 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  58.89 
 
 		 278 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0248  transposase/IS protein  50.51 
 
 		 281 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2334  transposase/IS protein  50.51 
 
 		 281 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0665572 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0452  transposase/IS protein  50.51 
 
 		 281 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.97098  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0953  transposase/IS protein  50.51 
 
 		 281 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.0557265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1263  transposase/IS protein  51.11 
 
 		 268 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00267464  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1500  IstB domain protein ATP-binding protein  47.11 
 
 		 252 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0247434  hitchhiker  0.000108884 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  47.11 
 
 		 252 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1176  IstB domain protein ATP-binding protein  47.11 
 
 		 252 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00428449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0019  transposase/IS protein  49.48 
 
 		 260 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2961  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3445  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2906  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000283064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3801  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3279  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3217  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000088143  normal  0.0723332 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3633  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3486  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3153  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.640291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4126  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.142881  normal  0.387354 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3671  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000902436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0635  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.144534  normal  0.136264 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2391  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  60 
 
 		 255 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0135  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0293303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4791  IstB ATP binding domain-containing protein  51.11 
 
 		 284 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2678  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0328651 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1293  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2798  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000346589  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0002  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000307192 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0016  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0315  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.107694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2526  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0531  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0444538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0449  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000734492 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0688  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0887  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0122074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2024  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1050  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0434314  normal  0.0157914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2587  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.160971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1905  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2089  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.184657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2154  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.108603  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2172  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0697469 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  48 
 
 		 491 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3952  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7662  transposase/IS protein  43.38 
 
 		 279 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  48 
 
 		 491 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  48 
 
 		 491 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  48 
 
 		 491 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  48 
 
 		 491 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  48 
 
 		 489 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  48 
 
 		 491 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  48 
 
 		 491 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2739  IstB domain protein ATP-binding protein  55.29 
 
 		 250 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0078  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  48 
 
 		 491 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  48 
 
 		 491 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0030  transposase/IS protein  48 
 
 		 259 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1792  IstB domain protein ATP-binding protein  48.67 
 
 		 259 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0650  IstB domain protein ATP-binding protein  48.67 
 
 		 259 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.499197 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2678  IstB domain protein ATP-binding protein  48.67 
 
 		 259 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.450987  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  48 
 
 		 491 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  48 
 
 		 491 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  48 
 
 		 491 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4687  IstB domain protein ATP-binding protein  47.17 
 
 		 261 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1041  IstB domain protein ATP-binding protein  47.17 
 
 		 261 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.614106  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0196  transposase/IS protein  42.65 
 
 		 278 aa  104  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183611 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3234  IstB ATP binding domain-containing protein  49.45 
 
 		 268 aa  104  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1581  transposon NTP-binding protein  44.64 
 
 		 261 aa  104  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0465434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>