More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2739 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2739  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
250 aa  511  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0338  IstB domain protein ATP-binding protein  87.15 
 
 
250 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3066  IstB domain protein ATP-binding protein  90.75 
 
 
251 aa  428  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2750  IstB-like ATP-binding protein  43.91 
 
 
241 aa  219  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.512582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0023  hypothetical protein  40.93 
 
 
240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0484  hypothetical protein  40.93 
 
 
240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1289  hypothetical protein  40.93 
 
 
240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2205  hypothetical protein  40.93 
 
 
240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2219  hypothetical protein  40.93 
 
 
240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.571769  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1801  DNA replication protein  45.05 
 
 
253 aa  186  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.272316  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  39.51 
 
 
248 aa  186  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2952  IstB-like ATP-binding protein  38.86 
 
 
241 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0026  DNA replication protein  45.05 
 
 
253 aa  186  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0857725  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0708  DNA replication protein  45.05 
 
 
253 aa  186  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.362412  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1655  DNA replication protein  45.05 
 
 
253 aa  186  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0316  DNA replication protein  45.05 
 
 
253 aa  186  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.759791  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1644  DNA replication protein  40.72 
 
 
261 aa  185  6e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1658  DNA replication protein  40.72 
 
 
261 aa  185  6e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0154  transposition protein IstB for insertion sequence IS1326  41.1 
 
 
260 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1581  transposon NTP-binding protein  41.1 
 
 
261 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0465434  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2908  transposase/IS protein  40.85 
 
 
257 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0541014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3406  transposase/IS protein  40.85 
 
 
257 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  40 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  40 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  40 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  40 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0047  transposase/IS protein  40.62 
 
 
264 aa  178  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2594  transposase/IS protein  40.62 
 
 
264 aa  178  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0285671  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09540  transposase/IS protein  42.44 
 
 
259 aa  178  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31550  transposase/IS protein  42.44 
 
 
259 aa  178  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36470  transposase/IS protein  42.44 
 
 
259 aa  178  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49640  transposase/IS protein  42.44 
 
 
259 aa  178  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0836597  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1500  IstB domain protein ATP-binding protein  40.41 
 
 
252 aa  176  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0247434  hitchhiker  0.000108884 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1176  IstB domain protein ATP-binding protein  40.41 
 
 
252 aa  176  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00428449  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  40.41 
 
 
252 aa  176  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1798  AAA-superfamily ATPase  42.25 
 
 
233 aa  176  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0320  transposase/IS protein  40.23 
 
 
264 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0341466 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1117  transposase/IS protein  40.23 
 
 
264 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1788  transposase/IS protein  40.23 
 
 
264 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2273  transposase/IS protein  40.23 
 
 
264 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00636107  hitchhiker  0.00023895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2538  transposase/IS protein  40.23 
 
 
264 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000073065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2587  transposase/IS protein  40.23 
 
 
264 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2796  transposase/IS protein  40.23 
 
 
264 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3281  transposase/IS protein  40.23 
 
 
264 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00423903  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1413  DNA replication protein  43.2 
 
 
254 aa  176  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0996  DNA replication protein  41.78 
 
 
261 aa  174  9e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.257554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1996  IstB-like ATP-binding protein  40.43 
 
 
241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0822  IstB-like ATP-binding protein  40.43 
 
 
241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00034623  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4687  IstB domain protein ATP-binding protein  39.33 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1041  IstB domain protein ATP-binding protein  39.33 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.614106  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0129  transposase  50.31 
 
 
267 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0484  IstB-like ATP-binding protein  39.42 
 
 
261 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3364  IstB-like ATP-binding protein  39.42 
 
 
261 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0021  transposase/IS protein  39.58 
 
 
264 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1564  transposase/IS protein  39.58 
 
 
264 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2885  transposase/IS protein  39.58 
 
 
264 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2557  IstB-like ATP-binding protein  38.17 
 
 
265 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2900  IstB-like ATP-binding protein  38.17 
 
 
265 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4867  IstB-like ATP-binding protein  38.17 
 
 
265 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4955  IstB-like ATP-binding protein  38.17 
 
 
265 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0005  IstB ATP binding domain-containing protein  38.17 
 
 
265 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3205  IstB ATP binding domain-containing protein  38.17 
 
 
265 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3298  IstB ATP binding domain-containing protein  38.17 
 
 
265 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1226  IstB domain protein ATP-binding protein  39.91 
 
 
245 aa  169  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5322  IstB-like ATP-binding protein  40.71 
 
 
275 aa  168  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1263  transposase/IS protein  39.37 
 
 
268 aa  168  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00267464  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  39.48 
 
 
262 aa  168  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03380  DNA replication protein  38.71 
 
 
254 aa  168  9e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.669388  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  39.48 
 
 
262 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  39.48 
 
 
262 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  39.48 
 
 
262 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  39.48 
 
 
262 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  39.48 
 
 
262 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  39.48 
 
 
262 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4202  IstB-like ATP-binding protein  50.32 
 
 
277 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25740  DNA replication protein  41.18 
 
 
267 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2411  IstB domain protein ATP-binding protein  42.79 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.11316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4065  IstB domain protein ATP-binding protein  42.79 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2885  IstB domain protein ATP-binding protein  42.79 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.46368e-23 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0357  transposase/IS protein  38.78 
 
 
262 aa  165  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  43.28 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  42.23 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  42.23 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  42.23 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0040  IstB domain protein ATP-binding protein  43 
 
 
243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0078  transposase/IS protein  41.75 
 
 
259 aa  164  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0030  transposase/IS protein  41.75 
 
 
259 aa  164  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3952  transposase/IS protein  41.75 
 
 
259 aa  164  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0452  transposase/IS protein  39.08 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.97098  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0449  transposase/IS protein  41.63 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000734492 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1293  transposase/IS protein  41.63 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0887  transposase/IS protein  41.63 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0122074  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0688  transposase/IS protein  41.63 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1050  transposase/IS protein  41.63 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0434314  normal  0.0157914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0531  transposase/IS protein  41.63 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0444538  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3279  transposase/IS protein  41.63 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2526  transposase/IS protein  41.63 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0565  IstB ATP binding domain-containing protein  38.49 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0923407  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2391  transposase/IS protein  41.63 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298615  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0553  IstB ATP binding domain-containing protein  38.49 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.668205  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>