More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2678 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0650  IstB domain protein ATP-binding protein  99.61 
 
 
259 aa  527  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.499197 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1792  IstB domain protein ATP-binding protein  99.61 
 
 
259 aa  527  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233354  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2678  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
259 aa  530  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.450987  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1677  IstB domain protein ATP-binding protein  98.84 
 
 
256 aa  518  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542778  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1594  IstB domain protein ATP-binding protein  98.46 
 
 
256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.366268  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1721  IstB domain protein ATP-binding protein  98.46 
 
 
256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0674  IstB domain protein ATP-binding protein  98.46 
 
 
256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.109995  hitchhiker  0.00130899 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0314  IstB domain protein ATP-binding protein  98.46 
 
 
256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.198752  normal  0.0610024 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3164  IstB ATP binding domain-containing protein  79.92 
 
 
260 aa  441  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0418  IstB-like ATP-binding protein  81.89 
 
 
255 aa  431  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176117  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1250  IstB-like ATP-binding protein  81.89 
 
 
255 aa  431  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3234  IstB ATP binding domain-containing protein  79.07 
 
 
268 aa  424  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3045  IS21 family transposase  75.68 
 
 
264 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488044  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1638  IS21 family transposase  75.68 
 
 
264 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3402  IS21 family transposase  75.68 
 
 
264 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0684  IS21 family transposase  75.29 
 
 
264 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1041  IstB domain protein ATP-binding protein  64.86 
 
 
261 aa  363  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.614106  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4687  IstB domain protein ATP-binding protein  64.86 
 
 
261 aa  363  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0484  IstB-like ATP-binding protein  65.25 
 
 
261 aa  361  7.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3364  IstB-like ATP-binding protein  65.25 
 
 
261 aa  361  7.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1581  transposon NTP-binding protein  68.15 
 
 
261 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0465434  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0154  transposition protein IstB for insertion sequence IS1326  68.15 
 
 
260 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2996  putative transposase  64.78 
 
 
277 aa  318  5e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1465  putative transposase  64.78 
 
 
277 aa  318  5e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1071  IstB domain protein ATP-binding protein  64.17 
 
 
265 aa  316  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388329  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3172  IstB domain protein ATP-binding protein  64.17 
 
 
265 aa  316  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2407  IstB domain protein ATP-binding protein  64.17 
 
 
265 aa  316  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0071  putative insertion sequence ATP-binding protein  61.57 
 
 
269 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4454  putative DNA replication protein  61.57 
 
 
269 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399205  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2114  IstB domain protein ATP-binding protein  62.04 
 
 
269 aa  315  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4202  IstB-like ATP-binding protein  63.07 
 
 
277 aa  314  8e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2557  IstB-like ATP-binding protein  60.48 
 
 
265 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2900  IstB-like ATP-binding protein  60.48 
 
 
265 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4867  IstB-like ATP-binding protein  60.48 
 
 
265 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4955  IstB-like ATP-binding protein  60.48 
 
 
265 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0005  IstB ATP binding domain-containing protein  60.48 
 
 
265 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3205  IstB ATP binding domain-containing protein  60.48 
 
 
265 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3298  IstB ATP binding domain-containing protein  60.48 
 
 
265 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3303  putative transposase  71.23 
 
 
253 aa  310  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.249042 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5322  IstB-like ATP-binding protein  62.7 
 
 
275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3051  IstB ATP binding domain-containing protein  58.61 
 
 
266 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.83256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0129  transposase  59.84 
 
 
267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0738  IstB ATP binding domain-containing protein  59.44 
 
 
273 aa  296  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0830  IstB ATP binding domain-containing protein  59.44 
 
 
273 aa  296  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1215  IstB ATP binding domain-containing protein  59.44 
 
 
273 aa  296  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3098  IstB ATP binding domain-containing protein  59.44 
 
 
273 aa  296  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0907  IstB domain protein ATP-binding protein  56.47 
 
 
245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1293  IstB domain protein ATP-binding protein  56.47 
 
 
245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2847  IstB domain protein ATP-binding protein  56.47 
 
 
245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2256  IstB domain protein ATP-binding protein  56.47 
 
 
245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3488  IstB domain protein ATP-binding protein  56.47 
 
 
245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1435  IstB domain protein ATP-binding protein  56.47 
 
 
245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0017  IstB domain protein ATP-binding protein  56.47 
 
 
245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0885  IstB domain protein ATP-binding protein  56.47 
 
 
245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00199941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2180  IstB domain protein ATP-binding protein  56.47 
 
 
245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1226  IstB domain protein ATP-binding protein  55.98 
 
 
245 aa  271  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2874  IstB ATP binding domain-containing protein  57.21 
 
 
245 aa  268  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00426393  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2865  IstB domain protein ATP-binding protein  55.17 
 
 
247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0985234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2885  IstB domain protein ATP-binding protein  55.9 
 
 
245 aa  264  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.46368e-23 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4065  IstB domain protein ATP-binding protein  55.9 
 
 
245 aa  264  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2411  IstB domain protein ATP-binding protein  55.9 
 
 
245 aa  264  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.11316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0040  IstB domain protein ATP-binding protein  54.62 
 
 
243 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0070  IstB domain protein ATP-binding protein  55.84 
 
 
243 aa  260  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.166344  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1108  IstB domain protein ATP-binding protein  56.03 
 
 
242 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3044  IstB-like ATP-binding protein  55.26 
 
 
287 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3057  IstB-like ATP-binding protein  55.26 
 
 
287 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.965627  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5104  IstB ATP binding domain-containing protein  54.2 
 
 
242 aa  254  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.34332 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2464  IstB ATP binding domain-containing protein  51.63 
 
 
242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.938722  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3391  IstB ATP binding domain-containing protein  51.63 
 
 
242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0313993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3052  IstB ATP binding domain-containing protein  51.63 
 
 
242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  51.63 
 
 
242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5131  IstB ATP binding domain-containing protein  51.63 
 
 
242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701045  normal  0.85319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0909  IstB ATP binding domain-containing protein  51.63 
 
 
242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0319  IstB-like ATP-binding protein  50.4 
 
 
287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3913  IstB-like ATP-binding protein  50.4 
 
 
287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668186  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2697  IstB ATP binding domain-containing protein  53.19 
 
 
239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.689881 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1203  IstB-like ATP-binding protein  50.4 
 
 
287 aa  253  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1038  IstB domain protein ATP-binding protein  52.97 
 
 
287 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4981  IstB ATP binding domain-containing protein  50.81 
 
 
242 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0900  IstB-like ATP-binding protein  50 
 
 
287 aa  250  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.704977  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3715  IstB-like ATP-binding protein  50 
 
 
287 aa  250  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0788  IstB-like ATP-binding protein  50 
 
 
287 aa  250  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.867709  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4172  IstB ATP binding domain-containing protein  55.26 
 
 
242 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2254  IstB ATP binding domain-containing protein  55.26 
 
 
242 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5399  IstB ATP binding domain-containing protein  55.26 
 
 
242 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1489  IstB domain protein ATP-binding protein  52.34 
 
 
242 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3577  IstB domain protein ATP-binding protein  52.34 
 
 
242 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3924  IstB-like ATP-binding protein  50.21 
 
 
287 aa  247  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0553  IstB ATP binding domain-containing protein  52.52 
 
 
242 aa  244  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.668205  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0565  IstB ATP binding domain-containing protein  52.52 
 
 
242 aa  244  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0923407  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0432  IstB-like ATP-binding protein  54.2 
 
 
242 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0234924  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0849  IstB-like ATP-binding protein  54.2 
 
 
242 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.152009  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2497  ATPase  57.43 
 
 
217 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6518  IstB ATP binding domain-containing protein  51.48 
 
 
244 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  normal  0.105365 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  47.89 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  40.83 
 
 
252 aa  175  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  40.83 
 
 
252 aa  175  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  40.83 
 
 
252 aa  175  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  40.83 
 
 
252 aa  175  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  38.74 
 
 
252 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>