More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2830 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  100 
 
 
252 aa  523  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  100 
 
 
252 aa  523  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  100 
 
 
252 aa  523  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  100 
 
 
252 aa  523  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1176  IstB domain protein ATP-binding protein  50 
 
 
252 aa  263  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00428449  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1500  IstB domain protein ATP-binding protein  50 
 
 
252 aa  263  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0247434  hitchhiker  0.000108884 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  50 
 
 
252 aa  263  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  47.37 
 
 
255 aa  249  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  47.37 
 
 
255 aa  249  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  47.37 
 
 
255 aa  249  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  50 
 
 
255 aa  240  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0708  IstB ATP binding domain-containing protein  51.67 
 
 
221 aa  234  9e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  43.29 
 
 
248 aa  214  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49640  transposase/IS protein  43.88 
 
 
259 aa  201  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0836597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31550  transposase/IS protein  43.88 
 
 
259 aa  201  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09540  transposase/IS protein  43.88 
 
 
259 aa  201  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36470  transposase/IS protein  43.88 
 
 
259 aa  201  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1025  IstB domain protein ATP-binding protein  42.42 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1263  transposase/IS protein  41.81 
 
 
268 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00267464  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0047  transposase/IS protein  44.07 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2594  transposase/IS protein  44.07 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0285671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0320  transposase/IS protein  43.64 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0341466 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1117  transposase/IS protein  43.64 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1788  transposase/IS protein  43.64 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2273  transposase/IS protein  43.64 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00636107  hitchhiker  0.00023895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2538  transposase/IS protein  43.64 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000073065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2587  transposase/IS protein  43.64 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2796  transposase/IS protein  43.64 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3281  transposase/IS protein  43.64 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00423903  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1998  IstB domain protein ATP-binding protein  42.02 
 
 
273 aa  195  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1257  IstB domain protein ATP-binding protein  42.02 
 
 
273 aa  195  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00361337  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1007  IstB domain protein ATP-binding protein  42.02 
 
 
273 aa  195  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1255  IstB domain protein ATP-binding protein  42.02 
 
 
273 aa  195  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000529674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0933  IstB domain protein ATP-binding protein  42.02 
 
 
273 aa  195  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1245  IstB domain protein ATP-binding protein  42.02 
 
 
273 aa  195  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0923  IstB domain protein ATP-binding protein  42.02 
 
 
273 aa  195  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  40 
 
 
252 aa  195  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  40 
 
 
252 aa  195  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  40 
 
 
252 aa  195  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  40 
 
 
252 aa  195  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0943  IstB domain protein ATP-binding protein  42.02 
 
 
273 aa  195  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000160717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  40.76 
 
 
259 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  40.76 
 
 
259 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0023  hypothetical protein  45.27 
 
 
240 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0484  hypothetical protein  45.27 
 
 
240 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1289  hypothetical protein  45.27 
 
 
240 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2205  hypothetical protein  45.27 
 
 
240 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2219  hypothetical protein  45.27 
 
 
240 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.571769  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  41.7 
 
 
258 aa  192  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  41.7 
 
 
258 aa  192  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  41.53 
 
 
264 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  41.53 
 
 
264 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  41.53 
 
 
264 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  41.53 
 
 
264 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  41.53 
 
 
264 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  41.53 
 
 
264 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  41.53 
 
 
264 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3445  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3279  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3801  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3671  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000902436  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3633  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4126  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.142881  normal  0.387354 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3486  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1050  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0434314  normal  0.0157914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0688  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0887  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0122074  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0016  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2587  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3217  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000088143  normal  0.0723332 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0531  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0444538  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2798  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000346589  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0002  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000307192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2526  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1905  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2089  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.184657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2024  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1293  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2154  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.108603  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2391  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298615  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2906  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000283064  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3153  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.640291  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0449  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000734492 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0635  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.144534  normal  0.136264 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2678  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0328651 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2172  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0697469 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2961  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0135  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0293303 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0315  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.107694  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0019  transposase/IS protein  39.48 
 
 
260 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  41.77 
 
 
262 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  41.77 
 
 
262 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  41.77 
 
 
262 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  40.93 
 
 
262 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  41.77 
 
 
262 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  41.77 
 
 
262 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  41.77 
 
 
262 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3952  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  188  7e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0030  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  188  7e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0078  transposase/IS protein  39.66 
 
 
259 aa  188  7e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>