More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3519 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3519  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.696579 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1827  hypothetical protein  92.86 
 
 
195 aa  158  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3557  hypothetical protein  92.86 
 
 
195 aa  158  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0800  IstB ATP binding domain-containing protein  93.94 
 
 
174 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.844919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  75.36 
 
 
284 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  77.94 
 
 
282 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  77.94 
 
 
289 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  77.94 
 
 
289 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  77.94 
 
 
289 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  77.94 
 
 
289 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  77.94 
 
 
289 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  76.39 
 
 
286 aa  106  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  75 
 
 
283 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  70.67 
 
 
309 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1009  transposase  70.59 
 
 
225 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5069  hypothetical protein  75.44 
 
 
106 aa  93.6  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8384  hypothetical protein  57.5 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  58.67 
 
 
278 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  58.67 
 
 
278 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  57.33 
 
 
278 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  64 
 
 
271 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  63.89 
 
 
267 aa  87  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  63.89 
 
 
267 aa  87  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  58.33 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  70.21 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3275  transposase orfB  63.64 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0481  hypothetical protein  62 
 
 
166 aa  58.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0580  integrase, catalytic region  45.83 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 
273 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  77.14 
 
 
231 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  77.14 
 
 
231 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  77.14 
 
 
231 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  77.14 
 
 
231 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6105  integrase catalytic region  43.37 
 
 
279 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2926  integrase catalytic region  43.37 
 
 
279 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  59.57 
 
 
251 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2633  integrase catalytic region  43.37 
 
 
279 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348098  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4739  integrase catalytic region  43.37 
 
 
279 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0441  integrase catalytic region  43.37 
 
 
279 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110873  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  44.12 
 
 
280 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  57.45 
 
 
250 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  46.97 
 
 
279 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0828  ISRSO14-transposase orfB protein  42.25 
 
 
275 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1492  ISRSO14-transposase orfB protein  42.25 
 
 
275 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0134955  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2405  ISRSO14-transposase orfB protein  42.25 
 
 
275 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1217  ISRSO14-transposase orfB protein  42.25 
 
 
275 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.163604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  39.76 
 
 
312 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_003296  RS05623  transposase  36.14 
 
 
305 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1303  transposase  36.14 
 
 
305 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0441  putative insertion element protein  55.32 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  44.29 
 
 
263 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 
345 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 
345 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 
345 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 
345 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 
345 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 
345 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 
345 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 
345 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  62.16 
 
 
240 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 
358 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  62.16 
 
 
240 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  62.16 
 
 
240 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  58.54 
 
 
250 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1301  integrase catalytic subunit  41.18 
 
 
276 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0008  putative insertion element protein  43.48 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1523  A, transposase OrfB  38.03 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0018  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0058  A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0152  A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0450  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0545  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0563  A, transposase OrfB  38.03 
 
 
797 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1379  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1560  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677585  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1692  A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1717  A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451919  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1740  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0828457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1751  A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1783  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1900  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1971  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2268  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2353  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2432  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2513  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.026452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2637  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2640  A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0406  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0471  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0565  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0644  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.491667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0923  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0979  IS1404 transposase  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1075  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536905  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1250  IS407A, transposase OrfB  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119711  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1472  IS1404 transposase  38.03 
 
 
277 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>