More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0791 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  100 
 
 
255 aa  517  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1500  IstB domain protein ATP-binding protein  66.12 
 
 
252 aa  352  4e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0247434  hitchhiker  0.000108884 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1176  IstB domain protein ATP-binding protein  66.12 
 
 
252 aa  352  4e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00428449  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  66.12 
 
 
252 aa  352  4e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  50 
 
 
252 aa  248  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  50 
 
 
252 aa  248  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  50 
 
 
252 aa  248  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  50 
 
 
252 aa  248  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  46.75 
 
 
255 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  46.75 
 
 
255 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  46.75 
 
 
255 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0708  IstB ATP binding domain-containing protein  48.33 
 
 
221 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  40.24 
 
 
252 aa  198  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  40.24 
 
 
252 aa  198  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  40.24 
 
 
252 aa  198  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  40.24 
 
 
252 aa  198  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  37.87 
 
 
248 aa  194  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  37.76 
 
 
259 aa  190  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  37.76 
 
 
259 aa  190  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2114  IstB domain protein ATP-binding protein  43.8 
 
 
269 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4202  IstB-like ATP-binding protein  44.77 
 
 
277 aa  188  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1360  IstB ATP binding domain-containing protein  39.83 
 
 
245 aa  188  7e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3265  IstB ATP binding domain-containing protein  52.25 
 
 
265 aa  188  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1622  IstB ATP binding domain-containing protein  41.95 
 
 
270 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0064  IstB ATP binding domain-containing protein  41.95 
 
 
270 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1870  IstB domain protein ATP-binding protein  42.19 
 
 
274 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0222  IstB domain protein ATP-binding protein  42.19 
 
 
274 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.923755  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3227  IstB domain protein ATP-binding protein  42.19 
 
 
274 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3016  IstB domain protein ATP-binding protein  42.19 
 
 
274 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5322  IstB-like ATP-binding protein  43.27 
 
 
275 aa  185  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1792  IstB domain protein ATP-binding protein  42.35 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233354  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0650  IstB domain protein ATP-binding protein  42.35 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.499197 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3051  IstB ATP binding domain-containing protein  41.74 
 
 
266 aa  182  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.83256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2678  IstB domain protein ATP-binding protein  42.23 
 
 
259 aa  183  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.450987  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1465  putative transposase  43.59 
 
 
277 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2996  putative transposase  43.59 
 
 
277 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  40.08 
 
 
264 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  40.08 
 
 
264 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  40.08 
 
 
264 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  40.08 
 
 
264 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  40.08 
 
 
264 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2537  IstB-like ATP-binding protein  39.92 
 
 
266 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  40.08 
 
 
264 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  40.08 
 
 
264 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3234  IstB ATP binding domain-containing protein  41.53 
 
 
268 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0071  putative insertion sequence ATP-binding protein  40.42 
 
 
269 aa  178  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4454  putative DNA replication protein  40.42 
 
 
269 aa  178  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399205  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1071  IstB domain protein ATP-binding protein  42.98 
 
 
265 aa  178  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388329  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2407  IstB domain protein ATP-binding protein  42.98 
 
 
265 aa  178  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3172  IstB domain protein ATP-binding protein  42.98 
 
 
265 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0338  IstB domain protein ATP-binding protein  43.57 
 
 
250 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0023  hypothetical protein  41.55 
 
 
240 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0484  hypothetical protein  41.55 
 
 
240 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1289  hypothetical protein  41.55 
 
 
240 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2205  hypothetical protein  41.55 
 
 
240 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2219  hypothetical protein  41.55 
 
 
240 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.571769  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  39.24 
 
 
265 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3164  IstB ATP binding domain-containing protein  42.8 
 
 
260 aa  176  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1108  IstB domain protein ATP-binding protein  41.2 
 
 
242 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3470  IstB domain protein ATP-binding protein  40.25 
 
 
259 aa  175  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000505364  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2557  IstB-like ATP-binding protein  40.57 
 
 
265 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2900  IstB-like ATP-binding protein  40.57 
 
 
265 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4867  IstB-like ATP-binding protein  40.57 
 
 
265 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4955  IstB-like ATP-binding protein  40.57 
 
 
265 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0005  IstB ATP binding domain-containing protein  40.57 
 
 
265 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3205  IstB ATP binding domain-containing protein  40.57 
 
 
265 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3298  IstB ATP binding domain-containing protein  40.57 
 
 
265 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2080  IstB domain protein ATP-binding protein  40.25 
 
 
259 aa  175  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00584299  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3046  IstB domain protein ATP-binding protein  40.25 
 
 
259 aa  175  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000101378  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0129  transposase  42.74 
 
 
267 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1046  IstB ATP binding domain-containing protein  36.6 
 
 
252 aa  174  8e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3714  IstB ATP binding domain-containing protein  41.03 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0070  IstB domain protein ATP-binding protein  43.04 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.166344  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0432  IstB-like ATP-binding protein  39.22 
 
 
242 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0234924  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0849  IstB-like ATP-binding protein  39.22 
 
 
242 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.152009  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0040  IstB domain protein ATP-binding protein  43.48 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  38.7 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  38.7 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  38.7 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  38.7 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  38.7 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  38.7 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0738  IstB ATP binding domain-containing protein  42.2 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0830  IstB ATP binding domain-containing protein  42.2 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1215  IstB ATP binding domain-containing protein  42.2 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3098  IstB ATP binding domain-containing protein  42.2 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2739  IstB domain protein ATP-binding protein  43.28 
 
 
250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0553  IstB ATP binding domain-containing protein  41.1 
 
 
242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.668205  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0469  IstB ATP binding domain-containing protein  41.13 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0565  IstB ATP binding domain-containing protein  41.1 
 
 
242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0923407  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4344  IstB ATP binding domain-containing protein  41.03 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3945  IstB ATP binding domain-containing protein  41.03 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4324  IstB ATP binding domain-containing protein  41.03 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2020  IstB ATP binding domain-containing protein  41.03 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2045  IstB ATP binding domain-containing protein  41.03 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2141  IstB ATP binding domain-containing protein  41.03 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.264877  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2181  IstB ATP binding domain-containing protein  41.03 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2322  IstB ATP binding domain-containing protein  41.03 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2647  IstB ATP binding domain-containing protein  41.03 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2667  IstB ATP binding domain-containing protein  41.03 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>