More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1176 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1176  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 252 aa  516  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00428449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1500  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 252 aa  516  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0247434  hitchhiker  0.000108884 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 252 aa  516  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  66.12 
 
 		 255 aa  340  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  50 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  50 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  50 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  50 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  43.51 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  43.51 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  43.51 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1360  IstB ATP binding domain-containing protein  40.6 
 
 		 245 aa  205  6e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0708  IstB ATP binding domain-containing protein  44.98 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  39.67 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  39.67 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0248  transposase/IS protein  46.22 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2334  transposase/IS protein  46.22 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0665572 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0452  transposase/IS protein  46.22 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.97098  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0953  transposase/IS protein  46.22 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.0557265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0196  transposase/IS protein  45.45 
 
 		 278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183611 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7662  transposase/IS protein  45.38 
 
 		 279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  41.38 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  41.38 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  41.38 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  41.38 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  41.38 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  41.38 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  41.38 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  39.92 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  39.92 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1046  IstB ATP binding domain-containing protein  39.83 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  37.1 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  37.1 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  37.1 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  37.1 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  37.77 
 
 		 248 aa  189  5e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  40.95 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  41.35 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  41.35 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  41.13 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  41.35 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2996  putative transposase  40.91 
 
 		 277 aa  185  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1465  putative transposase  40.91 
 
 		 277 aa  185  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0071  putative insertion sequence ATP-binding protein  39.83 
 
 		 269 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4454  putative DNA replication protein  39.83 
 
 		 269 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4929  IstB ATP binding domain-containing protein  37.55 
 
 		 285 aa  182  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5107  IstB ATP binding domain-containing protein  37.55 
 
 		 285 aa  182  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269436  normal  0.115979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  40.26 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  40.26 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  40.26 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  40.26 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5322  IstB-like ATP-binding protein  46.63 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  40.26 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  40.26 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09540  transposase/IS protein  40.34 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36470  transposase/IS protein  40.34 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1458  IstB-like ATP-binding protein  37.14 
 
 		 285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49640  transposase/IS protein  40.34 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0836597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31550  transposase/IS protein  40.34 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0047  transposase/IS protein  42.32 
 
 		 264 aa  181  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2594  transposase/IS protein  42.32 
 
 		 264 aa  181  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0285671  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03410  DNA replication protein  37.02 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.896278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0222  IstB domain protein ATP-binding protein  40.17 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.923755  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3016  IstB domain protein ATP-binding protein  40.17 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1870  IstB domain protein ATP-binding protein  40.17 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3227  IstB domain protein ATP-binding protein  40.17 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2537  IstB-like ATP-binding protein  39.57 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2114  IstB domain protein ATP-binding protein  40.93 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0320  transposase/IS protein  41.91 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0341466 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1117  transposase/IS protein  41.91 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1788  transposase/IS protein  41.91 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2273  transposase/IS protein  41.91 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00636107  hitchhiker  0.00023895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2538  transposase/IS protein  41.91 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000073065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2587  transposase/IS protein  41.91 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2796  transposase/IS protein  41.91 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3281  transposase/IS protein  41.91 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00423903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4202  IstB-like ATP-binding protein  40.91 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25740  DNA replication protein  40.68 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0129  transposase  42.21 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1263  transposase/IS protein  44.98 
 
 		 268 aa  178  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00267464  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  39.83 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  39.83 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3303  putative transposase  42.66 
 
 		 253 aa  178  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.249042 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0211  transposition helper protein, IS21 family  35.17 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233513 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  40.69 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3265  IstB ATP binding domain-containing protein  48.31 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2739  IstB domain protein ATP-binding protein  40.41 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2908  transposase/IS protein  42.41 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0541014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3406  transposase/IS protein  42.41 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1071  IstB domain protein ATP-binding protein  41.03 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388329  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2407  IstB domain protein ATP-binding protein  41.03 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0738  IstB ATP binding domain-containing protein  45.67 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0830  IstB ATP binding domain-containing protein  45.67 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1215  IstB ATP binding domain-containing protein  45.67 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3098  IstB ATP binding domain-containing protein  45.67 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0338  IstB domain protein ATP-binding protein  41.08 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0864  ISPsy4, transposition helper protein  39.75 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1096  ISPsy4, transposition helper protein  39.75 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.338234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4768  ISPsy4, transposition helper protein  39.75 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5370  ISPsy4, transposition helper protein  39.75 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.432722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>