12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4192 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4192    100 
 
 		 222 bp  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1829  hypothetical protein  88.35 
 
 		 825 bp  109  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3522  hypothetical protein  88.35 
 
 		 525 bp  109  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585082 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3559  hypothetical protein  88.35 
 
 		 525 bp  109  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1159    87.01 
 
 		 312 bp  73.8  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  87.01 
 
 		 855 bp  73.8  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4113  hypothetical protein  92.16 
 
 		 525 bp  69.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2015    85.29 
 
 		 929 bp  56  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  83.15 
 
 		 831 bp  50.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0309  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 1260 bp  48.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2522  Integrase catalytic region  83.58 
 
 		 462 bp  46.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.898977  normal  0.732387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  89.74 
 
 		 930 bp  46.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>