28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1159 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1159    100 
 
 		 312 bp  618  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 855 bp  618  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3522  hypothetical protein  91.74 
 
 		 525 bp  145  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585082 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1829  hypothetical protein  90.38 
 
 		 825 bp  127  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3559  hypothetical protein  90.38 
 
 		 525 bp  127  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  84.13 
 
 		 861 bp  91.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2015    83.21 
 
 		 929 bp  85.7  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  85 
 
 		 831 bp  79.8  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  82.44 
 
 		 930 bp  77.8  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4192    87.01 
 
 		 222 bp  73.8  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  81.89 
 
 		 849 bp  69.9  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 852 bp  58  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2522  Integrase catalytic region  83.33 
 
 		 462 bp  56  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.898977  normal  0.732387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  96.88 
 
 		 837 bp  56  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  96.88 
 
 		 837 bp  56  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1289    88 
 
 		 858 bp  52  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  93.94 
 
 		 753 bp  50.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    93.94 
 
 		 1142 bp  50.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  93.94 
 
 		 837 bp  50.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3677    93.94 
 
 		 728 bp  50.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  93.94 
 
 		 756 bp  50.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3120    83.33 
 
 		 890 bp  48.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.269434  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4342    93.75 
 
 		 225 bp  48.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  88.37 
 
 		 723 bp  46.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  88.37 
 
 		 723 bp  46.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  88.37 
 
 		 723 bp  46.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  88.37 
 
 		 525 bp  46.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  88.37 
 
 		 525 bp  46.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>