More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1829 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1829  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3559  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3522  hypothetical protein  98.61 
 
 		 174 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585082 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3560  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0475  hypothetical protein  97.3 
 
 		 74 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  80.25 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  79.01 
 
 		 283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  75.31 
 
 		 289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  75.31 
 
 		 289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  75.31 
 
 		 289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  75.31 
 
 		 289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  75.31 
 
 		 289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  72.84 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3963  hypothetical protein  96.72 
 
 		 508 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.81037  normal  0.136891 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  73.75 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  72.84 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  73.75 
 
 		 309 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  72.5 
 
 		 286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  69.14 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  69.14 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  69.14 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  69.14 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  69.14 
 
 		 174 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  69.14 
 
 		 174 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2522  Integrase catalytic region  70.51 
 
 		 153 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.898977  normal  0.732387 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  69.14 
 
 		 240 aa  125  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  69.14 
 
 		 240 aa  125  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  69.14 
 
 		 240 aa  125  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  64.2 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  64.2 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  64.2 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  47.1 
 
 		 170 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  64.2 
 
 		 209 aa  122  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  64.2 
 
 		 209 aa  122  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  66.67 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  65.43 
 
 		 278 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  65.43 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  65.43 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  65.43 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4686  Integrase catalytic region  72.15 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  64.56 
 
 		 250 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  57.5 
 
 		 273 aa  99  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  57.5 
 
 		 273 aa  99  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  57.5 
 
 		 273 aa  99  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2634  IS3 family transposase B  58.02 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000161209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4519  IS3 family transposase B  58.02 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000685336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  56.79 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  56.79 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  55.56 
 
 		 279 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0221  Integrase catalytic region  49.48 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0383  Integrase catalytic region  49.48 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0288014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3290  Integrase catalytic region  49.48 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1490  Integrase catalytic region  49.48 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00848161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1155  Integrase catalytic region  49.48 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.667808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1027  Integrase catalytic region  49.48 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0170  transposase B  56.79 
 
 		 227 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000123124  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 		 358 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17090  transposase  55.7 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0730  Integrase catalytic region  49.48 
 
 		 191 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0237424  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22000  transposase  55.7 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.208093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1671  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 		 162 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  56.41 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08090  transposase  55.7 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2014  Integrase catalytic region  53.16 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0828  ISRSO14-transposase orfB protein  50.57 
 
 		 275 aa  92.4  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1492  ISRSO14-transposase orfB protein  50.57 
 
 		 275 aa  92.4  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0134955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2405  ISRSO14-transposase orfB protein  50.57 
 
 		 275 aa  92.4  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1217  ISRSO14-transposase orfB protein  50.57 
 
 		 275 aa  92.4  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.163604 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0786  transposase B  53.16 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0156  transposase B  53.16 
 
 		 283 aa  92  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0960  transposase B  53.16 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.141184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1724  transposase B  53.16 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3883  transposase B  53.16 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  43.81 
 
 		 393 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  55.13 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3886  transposase B  53.16 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3814  transposase B  53.16 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2707  transposase B  53.16 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1549  transposase B  53.16 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0092  transposase B  53.16 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0381  integrase catalytic subunit  50.63 
 
 		 189 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0916  IS1404 transposase  48.91 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.08835  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  51.22 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>