More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0170 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0170  transposase B  100 
 
 
227 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000123124  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  91.63 
 
 
279 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  92.07 
 
 
279 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  92.07 
 
 
279 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2634  IS3 family transposase B  88.99 
 
 
279 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000161209  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4519  IS3 family transposase B  88.99 
 
 
279 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000685336  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  68.33 
 
 
273 aa  301  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  68.33 
 
 
273 aa  301  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  68.33 
 
 
273 aa  301  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  51.83 
 
 
276 aa  211  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  50 
 
 
271 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  50 
 
 
267 aa  210  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  50 
 
 
267 aa  210  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  50.46 
 
 
284 aa  202  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  53.16 
 
 
209 aa  200  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  53.16 
 
 
209 aa  200  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  49.54 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  49.54 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  49.54 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  49.54 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1027  Integrase catalytic region  45.16 
 
 
284 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0383  Integrase catalytic region  45.16 
 
 
284 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0288014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1490  Integrase catalytic region  45.16 
 
 
284 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00848161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0221  Integrase catalytic region  44.59 
 
 
285 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3290  Integrase catalytic region  44.59 
 
 
285 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1155  Integrase catalytic region  45.16 
 
 
284 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.667808  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  48.17 
 
 
240 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  48.17 
 
 
240 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  48.17 
 
 
240 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  47.71 
 
 
283 aa  192  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  46.98 
 
 
289 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  47.44 
 
 
282 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  46.7 
 
 
309 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  46.98 
 
 
289 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  46.98 
 
 
289 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  46.98 
 
 
289 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  46.98 
 
 
289 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  46.05 
 
 
286 aa  184  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0786  transposase B  46.22 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0960  transposase B  46.22 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.141184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1724  transposase B  46.22 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233421  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0156  transposase B  46.22 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3886  transposase B  46.22 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3883  transposase B  46.22 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3814  transposase B  46.22 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2707  transposase B  46.22 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1549  transposase B  46.22 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0092  transposase B  46.22 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  48.47 
 
 
250 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  48.47 
 
 
250 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  48.47 
 
 
250 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  48.47 
 
 
250 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  48.47 
 
 
250 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  48.47 
 
 
250 aa  181  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  48.47 
 
 
250 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  48.47 
 
 
250 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  48.47 
 
 
250 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  48.47 
 
 
250 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  48.47 
 
 
345 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  48.47 
 
 
345 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  48.47 
 
 
345 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  48.47 
 
 
345 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  48.47 
 
 
358 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  45.66 
 
 
273 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  48.47 
 
 
345 aa  180  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  48.47 
 
 
345 aa  180  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  48.47 
 
 
345 aa  180  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  48.47 
 
 
345 aa  180  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  45.45 
 
 
278 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  44.55 
 
 
278 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  44.55 
 
 
278 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  44.55 
 
 
250 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  44.44 
 
 
265 aa  174  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2522  Integrase catalytic region  57.24 
 
 
153 aa  174  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.898977  normal  0.732387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  43.18 
 
 
250 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  54.61 
 
 
174 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  54.61 
 
 
174 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  44.17 
 
 
269 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  44.17 
 
 
269 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  44.17 
 
 
269 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  43.89 
 
 
251 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  44.17 
 
 
269 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  42.72 
 
 
307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  42.25 
 
 
290 aa  165  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  42.25 
 
 
290 aa  165  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  40.38 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  41.78 
 
 
309 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  41.55 
 
 
280 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  42.25 
 
 
290 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  42.25 
 
 
290 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2014  Integrase catalytic region  42.47 
 
 
297 aa  160  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  40.38 
 
 
309 aa  158  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  40.38 
 
 
309 aa  158  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  40.38 
 
 
309 aa  158  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  41.44 
 
 
280 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  40.85 
 
 
284 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2543  Integrase catalytic region  43.18 
 
 
280 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  41.31 
 
 
277 aa  154  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1077  IS407A, transposase OrfB  41.31 
 
 
277 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0283  IS407A, transposase OrfB  41.31 
 
 
277 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.010372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>