More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3560 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1829  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  153  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3560  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  152  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0475  hypothetical protein  97.3 
 
 		 74 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131533 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4686  Integrase catalytic region  71.62 
 
 		 266 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6125  integrase catalytic region  63.64 
 
 		 289 aa  84.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4975  integrase core subunit  55.07 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0663  transposase  50 
 
 		 279 aa  68.2  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0850  transposase  50 
 
 		 279 aa  68.2  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0854  transposase  50 
 
 		 279 aa  68.2  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0884  transposase  50 
 
 		 279 aa  68.2  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1036  transposase  50 
 
 		 279 aa  68.2  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0036769  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1087  transposase  50 
 
 		 279 aa  68.2  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1671  transposase  50 
 
 		 279 aa  68.2  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1413  transposase  50 
 
 		 279 aa  68.2  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.143794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0761  integrase catalytic subunit  50.7 
 
 		 169 aa  63.5  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  43.24 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0353  transposase  45.45 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0103565  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1493  transposase  45.45 
 
 		 196 aa  60.5  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  43.66 
 
 		 319 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  46.97 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  46.97 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2163  integrase catalytic region  45.83 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1946  integrase catalytic region  45.83 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2285  integrase catalytic region  45.83 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  46.97 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  46.97 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  46.97 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  46.97 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  46.97 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  46.97 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  46.97 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  46.97 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  46.97 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0681  transposase  45.45 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.606011  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1677  transposase  45.45 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2299  transposase  45.45 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.224442  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2330  transposase  45.45 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  51.47 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  51.47 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  51.47 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  51.47 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  51.47 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  45.45 
 
 		 278 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0121  transposase  44.93 
 
 		 284 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0597  transposase  44.93 
 
 		 284 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0684  transposase  44.93 
 
 		 284 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0708  transposase  44.93 
 
 		 284 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.042465  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0906  transposase  44.93 
 
 		 284 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0963  transposase  44.93 
 
 		 279 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0993  transposase  44.93 
 
 		 279 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.078636  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1167  transposase  44.93 
 
 		 284 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1214  transposase  44.93 
 
 		 284 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.933809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1292  transposase  44.93 
 
 		 284 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.572072  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1357  transposase  44.93 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1365  transposase  44.93 
 
 		 284 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1504  transposase  44.93 
 
 		 284 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0105855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1591  transposase  44.93 
 
 		 284 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.401924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1635  transposase  44.93 
 
 		 284 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1797  transposase  44.93 
 
 		 284 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1928  transposase  44.93 
 
 		 284 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.406161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1966  transposase  44.93 
 
 		 284 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1993  transposase  44.93 
 
 		 284 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  43.94 
 
 		 272 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0038  transposase  44.93 
 
 		 284 aa  57.8  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1879  Integrase catalytic region  41.33 
 
 		 222 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2230  integrase catalytic subunit  44.78 
 
 		 198 aa  57  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.226944  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  46.27 
 
 		 286 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1871  transposase  43.48 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0349694  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  41.1 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  45.59 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  47.3 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  47.3 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01089  transposase and inactivated derivatives  40.3 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  39.71 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  39.71 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0867  Integrase catalytic region  41.33 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  42.42 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3747  ISRSO8-transposase orfB protein  43.48 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.916581  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  39.71 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0871  Integrase catalytic region  41.33 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0548132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06225  transposase and inactivated derivatives  40.3 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  45.45 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  42.42 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.45 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  39.71 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  50 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.45 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0624  putative transposase B  43.48 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.45 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.45 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.45 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  50 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36460  Integrase, catalytic domain-containing protein  45.45 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  47.3 
 
 		 286 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  46.97 
 
 		 286 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  47.3 
 
 		 286 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  47.3 
 
 		 286 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  47.3 
 
 		 286 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  47.3 
 
 		 286 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  47.3 
 
 		 286 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>