More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4975 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4975  integrase core subunit  100 
 
 		 274 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6125  integrase catalytic region  51.87 
 
 		 289 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4686  Integrase catalytic region  44.23 
 
 		 266 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  41.35 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  41.35 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  40.98 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  40.98 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  40.98 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  40.07 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  40.07 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  39.56 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  40.07 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  40.07 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  40.07 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  41.33 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  41.33 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  39.34 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  39.56 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  39.34 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  42.07 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  42.07 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  42.07 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  42.07 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  42.07 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  42.07 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  42.07 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  42.07 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  42.07 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  42.07 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  39.19 
 
 		 293 aa  178  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  41.7 
 
 		 286 aa  178  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  42.07 
 
 		 286 aa  178  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  39.19 
 
 		 302 aa  178  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  42.07 
 
 		 319 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3686  Integrase catalytic region  38.77 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181009  normal  0.0371116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  38.89 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  38.89 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  38.89 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  38.89 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  38.89 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  38.89 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  38.89 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  38.89 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  38.89 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  38.89 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  38.89 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 374 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 		 374 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  40.45 
 
 		 374 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  40.45 
 
 		 374 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  40.45 
 
 		 374 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  40.45 
 
 		 374 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  40.45 
 
 		 374 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  39.05 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  39.05 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  39.05 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  39.05 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  39.05 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  39.05 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  37.55 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02081  Integrase  36.57 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.922078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03751  Integrase  36.57 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.589934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01551  integrase  36.57 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.648789  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1569  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  41.11 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  38.35 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  38.35 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  38.35 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  38.35 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  38.35 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  38.06 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1686  ISCps9, transposase orfB  35.19 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2857  ISCps9, transposase orfB  35.19 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0915718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2962  ISCps9, transposase orfB  35.19 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3122  ISCps9, transposase orfB  35.19 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3581  integrase catalytic subunit  37.83 
 
 		 298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3627  integrase catalytic subunit  37.83 
 
 		 298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4706  integrase catalytic subunit  37.83 
 
 		 298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  34.41 
 
 		 291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  37.31 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.43 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.43 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.43 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.43 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.43 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1896  ISCps9, transposase orfB, truncated  35.09 
 
 		 266 aa  161  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  37.5 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  35 
 
 		 278 aa  159  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1183  integrase catalytic subunit  36.53 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0773839 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  37.83 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0624  putative transposase B  40.6 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1233  putative transposase B  40.6 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1298  putative transposase B  40.6 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0663  transposase  36.15 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0850  transposase  36.15 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0854  transposase  36.15 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0884  transposase  36.15 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1036  transposase  36.15 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0036769  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1087  transposase  36.15 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1671  transposase  36.15 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1413  transposase  36.15 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.143794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>