More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1896 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1896  ISCps9, transposase orfB, truncated  100 
 
 
266 aa  556  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1686  ISCps9, transposase orfB  100 
 
 
295 aa  536  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2857  ISCps9, transposase orfB  100 
 
 
295 aa  536  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0915718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2962  ISCps9, transposase orfB  100 
 
 
295 aa  536  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3122  ISCps9, transposase orfB  100 
 
 
295 aa  536  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0894  ISCps3, transposase orfB  47.43 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274817  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2958  ISCps3, transposase orfB  46.64 
 
 
295 aa  247  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0431063  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  41.57 
 
 
286 aa  208  9e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  40.23 
 
 
278 aa  202  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  40.23 
 
 
270 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  40.23 
 
 
270 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  40.31 
 
 
286 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  40.31 
 
 
286 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  40.31 
 
 
286 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  40.31 
 
 
286 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  40.31 
 
 
286 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  39.3 
 
 
291 aa  198  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  38.74 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  37.25 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  37.25 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  37.25 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  39.16 
 
 
270 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  39.16 
 
 
270 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  39.16 
 
 
270 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  39.16 
 
 
270 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  39.16 
 
 
270 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  39.76 
 
 
286 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  39.76 
 
 
286 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  39.76 
 
 
286 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  39.76 
 
 
286 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  39.76 
 
 
286 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  39.76 
 
 
286 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  39.76 
 
 
286 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  39.76 
 
 
286 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  39.76 
 
 
286 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  39.76 
 
 
286 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  39.76 
 
 
286 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  39.37 
 
 
286 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  39.37 
 
 
286 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  39.37 
 
 
286 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  38.43 
 
 
277 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  36.68 
 
 
271 aa  187  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  39.38 
 
 
272 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  39.13 
 
 
288 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  38.34 
 
 
274 aa  185  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.02 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.02 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.02 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.02 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.02 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1569  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  41.83 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  38.74 
 
 
302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  38.74 
 
 
293 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  36.74 
 
 
294 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  38.74 
 
 
302 aa  182  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  36.72 
 
 
291 aa  183  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  38.74 
 
 
293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  36.09 
 
 
302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  38.19 
 
 
285 aa  182  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  35.52 
 
 
271 aa  179  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  38.65 
 
 
286 aa  178  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1397  transposase-like  37.6 
 
 
279 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1744  transposase-like  37.6 
 
 
279 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2872  transposase-like  37.6 
 
 
279 aa  175  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  35.69 
 
 
288 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  39.13 
 
 
286 aa  175  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  36.05 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  36.05 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  36.05 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  37.01 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  37.01 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  37.01 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  37.01 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  37.01 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  37.01 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  37.01 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  37.01 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  36.9 
 
 
274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  37.01 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  37.01 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  37.01 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  37.01 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  36.9 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  38.19 
 
 
296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  38.19 
 
 
296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  38.19 
 
 
296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  38.19 
 
 
296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  38.76 
 
 
277 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  38.76 
 
 
293 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  38.76 
 
 
293 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  38.76 
 
 
293 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  37.24 
 
 
291 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  37.24 
 
 
291 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  37.74 
 
 
267 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  37.15 
 
 
319 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  37.74 
 
 
267 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  37.35 
 
 
271 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  37.74 
 
 
269 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  39.04 
 
 
288 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  39.04 
 
 
288 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>