More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3122 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1686  ISCps9, transposase orfB  100 
 
 		 295 aa  617  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2857  ISCps9, transposase orfB  100 
 
 		 295 aa  617  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0915718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2962  ISCps9, transposase orfB  100 
 
 		 295 aa  617  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3122  ISCps9, transposase orfB  100 
 
 		 295 aa  617  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1896  ISCps9, transposase orfB, truncated  100 
 
 		 266 aa  536  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0894  ISCps3, transposase orfB  47.42 
 
 		 295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274817  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2958  ISCps3, transposase orfB  46.74 
 
 		 295 aa  277  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0431063  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  41.99 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  40.85 
 
 		 286 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  40.85 
 
 		 286 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  40.85 
 
 		 286 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  40.85 
 
 		 286 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  40.85 
 
 		 286 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  40.14 
 
 		 291 aa  219  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  39.5 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  39.5 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  39.5 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  39.5 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  39.5 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  39.5 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  39.5 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  39.5 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  39.15 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  39.15 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  39.5 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  39.5 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  41.18 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  39.5 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  40.82 
 
 		 270 aa  216  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  40.82 
 
 		 270 aa  216  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  39.15 
 
 		 286 aa  215  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  39.33 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  39.78 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  39.78 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  39.78 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  39.78 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  39.78 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  37.78 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  37.78 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  37.78 
 
 		 280 aa  209  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  37.59 
 
 		 291 aa  208  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  40 
 
 		 286 aa  208  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  38.52 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.24 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  40.37 
 
 		 272 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.24 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.24 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.24 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.24 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  38.57 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  38.57 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  40 
 
 		 288 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  38.57 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  38.57 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  40.36 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  39.47 
 
 		 277 aa  202  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  37.77 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 		 271 aa  199  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1569  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  40.36 
 
 		 285 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  36.17 
 
 		 288 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  37.93 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  36.46 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  35.79 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  35.79 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  35.79 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  38.11 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  38.11 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  38.11 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  38.11 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  38.11 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  38.11 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  38.11 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  38.11 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  38.11 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  38.11 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  38.11 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  38.11 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  38.11 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  38.11 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  38.11 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  38.26 
 
 		 274 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  37.76 
 
 		 288 aa  191  9e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  36.3 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  37.19 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  36.88 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  38.95 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  38.95 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  38.95 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  37.19 
 
 		 289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1397  transposase-like  38.24 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1744  transposase-like  38.24 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  34.84 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0188  integrase catalytic region  38.65 
 
 		 287 aa  188  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2872  transposase-like  38.29 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  36.33 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  36.33 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  37.01 
 
 		 296 aa  185  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  37.01 
 
 		 296 aa  185  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  37.01 
 
 		 296 aa  185  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  37.01 
 
 		 296 aa  185  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>