More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0353 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0038  transposase  100 
 
 
284 aa  287  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0121  transposase  100 
 
 
284 aa  287  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0597  transposase  100 
 
 
284 aa  287  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0681  transposase  100 
 
 
284 aa  287  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.606011  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0684  transposase  100 
 
 
284 aa  287  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0708  transposase  100 
 
 
284 aa  287  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.042465  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1167  transposase  100 
 
 
284 aa  287  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1292  transposase  100 
 
 
284 aa  287  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.572072  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1365  transposase  100 
 
 
284 aa  287  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1504  transposase  100 
 
 
284 aa  287  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0105855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1591  transposase  100 
 
 
284 aa  287  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.401924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1797  transposase  100 
 
 
284 aa  287  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1928  transposase  100 
 
 
284 aa  287  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.406161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2330  transposase  100 
 
 
251 aa  286  6e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1871  transposase  99.26 
 
 
284 aa  286  9e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0349694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1214  transposase  99.26 
 
 
284 aa  285  1e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.933809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1357  transposase  100 
 
 
240 aa  285  1e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1966  transposase  99.26 
 
 
284 aa  285  1e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1993  transposase  99.26 
 
 
284 aa  285  1e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1493  transposase  100 
 
 
196 aa  285  2e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1635  transposase  99.26 
 
 
284 aa  285  2e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1677  transposase  99.26 
 
 
284 aa  285  2e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0353  transposase  100 
 
 
136 aa  284  2.9999999999999996e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0103565  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0963  transposase  98.53 
 
 
279 aa  283  5e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0993  transposase  98.53 
 
 
279 aa  283  5e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.078636  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2299  transposase  99.26 
 
 
251 aa  283  5.999999999999999e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.224442  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0906  transposase  98.53 
 
 
284 aa  282  1.0000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0115  transposase  96.99 
 
 
281 aa  274  4e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00142442  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C59  transposase  91.06 
 
 
234 aa  238  2e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2285  integrase catalytic region  47.41 
 
 
271 aa  134  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2163  integrase catalytic region  47.41 
 
 
271 aa  134  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1946  integrase catalytic region  47.41 
 
 
271 aa  134  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0761  integrase catalytic subunit  48.12 
 
 
169 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  45.86 
 
 
270 aa  123  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  45.86 
 
 
270 aa  123  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  45.86 
 
 
270 aa  123  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  45.86 
 
 
270 aa  123  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  45.86 
 
 
270 aa  123  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0953  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 
393 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1444  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 
390 aa  121  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3173  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 
390 aa  121  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3934  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 
390 aa  121  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580476  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  45.86 
 
 
270 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  45.86 
 
 
270 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  42.96 
 
 
281 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  40.15 
 
 
272 aa  116  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1024  integrase catalytic subunit  43.41 
 
 
284 aa  115  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0659749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0731  integrase catalytic subunit  43.41 
 
 
284 aa  115  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.100278  decreased coverage  0.000000433601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1053  integrase catalytic subunit  43.41 
 
 
284 aa  115  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1028  integrase catalytic subunit  43.41 
 
 
284 aa  115  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0775486 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1120  integrase catalytic subunit  43.41 
 
 
284 aa  115  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1356  integrase catalytic subunit  43.41 
 
 
284 aa  115  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1476  integrase catalytic subunit  43.41 
 
 
284 aa  115  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.725105  normal  0.179126 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1358  integrase catalytic subunit  43.41 
 
 
208 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1315  integrase catalytic subunit  43.41 
 
 
284 aa  115  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0663  transposase  40.6 
 
 
279 aa  114  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0850  transposase  40.6 
 
 
279 aa  114  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0854  transposase  40.6 
 
 
279 aa  114  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0884  transposase  40.6 
 
 
279 aa  114  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1036  transposase  40.6 
 
 
279 aa  114  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0036769  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1087  transposase  40.6 
 
 
279 aa  114  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1671  transposase  40.6 
 
 
279 aa  114  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1413  transposase  40.6 
 
 
279 aa  114  5e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.143794  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0624  putative transposase B  41.04 
 
 
272 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1233  putative transposase B  41.04 
 
 
272 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1298  putative transposase B  41.04 
 
 
272 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  43.08 
 
 
274 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  43.08 
 
 
286 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  40.6 
 
 
278 aa  110  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  42.65 
 
 
295 aa  110  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  42.65 
 
 
295 aa  110  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  42.65 
 
 
295 aa  110  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  42.65 
 
 
295 aa  110  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  42.65 
 
 
295 aa  110  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  42.65 
 
 
295 aa  110  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  38.64 
 
 
271 aa  110  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 
271 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 
271 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 
271 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 
271 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  40.91 
 
 
294 aa  110  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3750  putative transposase B  41.04 
 
 
198 aa  110  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  39.39 
 
 
286 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  39.39 
 
 
286 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  39.39 
 
 
286 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36460  Integrase, catalytic domain-containing protein  39.39 
 
 
200 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  39.39 
 
 
286 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  40.3 
 
 
280 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06247  integrase  40.6 
 
 
283 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  40.3 
 
 
280 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  39.39 
 
 
286 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1183  integrase catalytic subunit  41.18 
 
 
276 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0773839 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0096  ISSd1, transposase OrfB  40.15 
 
 
244 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00302265  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0765  integrase catalytic subunit  38.64 
 
 
271 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  39.1 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  43.18 
 
 
289 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  39.1 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  40.77 
 
 
379 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  40.15 
 
 
272 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0021  ISSd1, transposase orfB  40.15 
 
 
272 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>