28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1091 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1091    100 
 
 		 150 bp  297  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  98.65 
 
 		 756 bp  278  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1038    97.28 
 
 		 183 bp  260  9e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  96.67 
 
 		 837 bp  258  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  96.67 
 
 		 837 bp  258  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0151  hypothetical protein  95.33 
 
 		 216 bp  242  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0107  hypothetical protein  95.33 
 
 		 216 bp  242  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1130    95.24 
 
 		 183 bp  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0568    94.52 
 
 		 159 bp  226  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0794854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4009    89.8 
 
 		 180 bp  172  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.223368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4219    90.07 
 
 		 839 bp  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0535  hypothetical protein  89.66 
 
 		 309 bp  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4225    87.5 
 
 		 189 bp  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3976    87.6 
 
 		 171 bp  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3677    85.71 
 
 		 728 bp  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  85.4 
 
 		 753 bp  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3972    92.59 
 
 		 150 bp  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    85.4 
 
 		 1142 bp  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  85.4 
 
 		 837 bp  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5442    85.4 
 
 		 189 bp  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1289    84.72 
 
 		 858 bp  111  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0104    84.72 
 
 		 204 bp  111  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4830    85.11 
 
 		 167 bp  105  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4342    92.75 
 
 		 225 bp  97.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1508    84.5 
 
 		 204 bp  97.6  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4717    84.25 
 
 		 821 bp  93.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  81.4 
 
 		 753 bp  65.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0797  hypothetical protein  93.75 
 
 		 162 bp  48.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0461181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>