28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5442 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5442    100 
 
 		 189 bp  375  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  99.47 
 
 		 753 bp  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    98.94 
 
 		 1142 bp  359  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  98.94 
 
 		 837 bp  359  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4225    95 
 
 		 189 bp  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1289    88.36 
 
 		 858 bp  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0104    90.97 
 
 		 204 bp  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3972    90 
 
 		 150 bp  178  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4342    86.11 
 
 		 225 bp  159  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  85.19 
 
 		 837 bp  153  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  86.13 
 
 		 837 bp  153  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0535  hypothetical protein  85.56 
 
 		 309 bp  151  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1038    85.56 
 
 		 183 bp  151  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4219    85.55 
 
 		 839 bp  145  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0151  hypothetical protein  85 
 
 		 216 bp  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0107  hypothetical protein  85 
 
 		 216 bp  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1130    84.44 
 
 		 183 bp  135  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  83.82 
 
 		 756 bp  121  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4717    87.93 
 
 		 821 bp  119  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1091    85.4 
 
 		 150 bp  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0568    85.4 
 
 		 159 bp  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0794854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1508    84.62 
 
 		 204 bp  99.6  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3677    82.88 
 
 		 728 bp  91.7  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4009    81.36 
 
 		 180 bp  89.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.223368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  82.35 
 
 		 753 bp  89.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4830    83.22 
 
 		 167 bp  85.7  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2815    83.08 
 
 		 240 bp  83.8  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3976    83.1 
 
 		 171 bp  46.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304655  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>