38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4219 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4717    85.56 
 
 		 821 bp  676    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  88.08 
 
 		 837 bp  854    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  88.44 
 
 		 837 bp  878    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4219    100 
 
 		 839 bp  1663    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3677    86.91 
 
 		 728 bp  664    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  87.3 
 
 		 756 bp  710    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1289    86.61 
 
 		 858 bp  733    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  88.8 
 
 		 837 bp  902    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    88.76 
 
 		 1142 bp  896    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  88.72 
 
 		 753 bp  795    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4338    87.18 
 
 		 619 bp  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  83.27 
 
 		 753 bp  458  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0441  putative insertion element protein  91.59 
 
 		 336 bp  406  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0535  hypothetical protein  96.61 
 
 		 309 bp  303  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1038    92.66 
 
 		 183 bp  248  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8384  hypothetical protein  88 
 
 		 405 bp  242  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0151  hypothetical protein  90.75 
 
 		 216 bp  216  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0107  hypothetical protein  90.75 
 
 		 216 bp  216  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1130    89.83 
 
 		 183 bp  208  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4225    87.77 
 
 		 189 bp  190  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1091    90.07 
 
 		 150 bp  168  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0568    88.24 
 
 		 159 bp  161  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0794854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0104    85.64 
 
 		 204 bp  159  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4342    83.56 
 
 		 225 bp  153  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3972    91.15 
 
 		 150 bp  145  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5442    85.55 
 
 		 189 bp  145  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4009    84.48 
 
 		 180 bp  131  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.223368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1508    83.72 
 
 		 204 bp  119  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4830    83.83 
 
 		 167 bp  109  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0170    84.67 
 
 		 249 bp  105  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0366514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0226  hypothetical protein  84.67 
 
 		 351 bp  105  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3976    82.04 
 
 		 171 bp  93.7  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2815    83.85 
 
 		 240 bp  91.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  90.2 
 
 		 831 bp  61.9  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  87.5 
 
 		 861 bp  56  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3056  putative transcriptional regulator  94.44 
 
 		 300 bp  56  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.132705 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2522  Integrase catalytic region  100 
 
 		 462 bp  48.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.898977  normal  0.732387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6414  integrase catalytic region  93.75 
 
 		 822 bp  48.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>