29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2815 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2815    100 
 
 		 240 bp  476  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  93.22 
 
 		 753 bp  170  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4225    87.18 
 
 		 189 bp  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4338    86.44 
 
 		 619 bp  107  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0535  hypothetical protein  85.38 
 
 		 309 bp  107  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3972    85.27 
 
 		 150 bp  105  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3677    84.87 
 
 		 728 bp  93.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  84.75 
 
 		 837 bp  91.7  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4219    83.85 
 
 		 839 bp  91.7  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  84.75 
 
 		 837 bp  91.7  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    85.32 
 
 		 1142 bp  89.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  85.32 
 
 		 837 bp  89.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  85.32 
 
 		 753 bp  89.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4717    84.48 
 
 		 821 bp  87.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  83.9 
 
 		 756 bp  83.8  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1508    83.08 
 
 		 204 bp  83.8  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1038    83.08 
 
 		 183 bp  83.8  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5442    83.08 
 
 		 189 bp  83.8  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1289    83.9 
 
 		 858 bp  83.8  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4342    84.4 
 
 		 225 bp  81.8  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0441  putative insertion element protein  90.16 
 
 		 336 bp  73.8  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1130    82.11 
 
 		 183 bp  69.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0151  hypothetical protein  81.54 
 
 		 216 bp  67.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0107  hypothetical protein  81.54 
 
 		 216 bp  67.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0104    80.77 
 
 		 204 bp  60  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4830    84.21 
 
 		 167 bp  56  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0568    82.35 
 
 		 159 bp  50.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0794854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0170    93.94 
 
 		 249 bp  50.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0366514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0226  hypothetical protein  93.94 
 
 		 351 bp  50.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350156  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>