129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0226 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0226  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  77.63 
 
 		 278 aa  121  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  77.63 
 
 		 250 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  76.32 
 
 		 251 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  73.68 
 
 		 278 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  72.37 
 
 		 250 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  71.05 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  48.68 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  48.68 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  48.68 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  48.68 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  48.68 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  43.42 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2522  Integrase catalytic region  43.42 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.898977  normal  0.732387 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  43.42 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  39.47 
 
 		 289 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  39.47 
 
 		 289 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  39.47 
 
 		 289 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  39.47 
 
 		 289 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  39.47 
 
 		 289 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  44.74 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  39.47 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  39.47 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  39.47 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  39.47 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  39.47 
 
 		 209 aa  62  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  39.47 
 
 		 209 aa  62  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  39.47 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  42.11 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  39.47 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  39.47 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  36.84 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  43.42 
 
 		 283 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  34.21 
 
 		 265 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0960  transposase B  34.67 
 
 		 284 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.141184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1724  transposase B  34.67 
 
 		 284 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0092  transposase B  34.67 
 
 		 284 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1549  transposase B  34.67 
 
 		 284 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2707  transposase B  34.67 
 
 		 284 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3814  transposase B  34.67 
 
 		 284 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3883  transposase B  34.67 
 
 		 284 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3886  transposase B  34.67 
 
 		 284 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0786  transposase B  34.67 
 
 		 284 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0156  transposase B  34.67 
 
 		 283 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1778  transposase OrfB  26.32 
 
 		 288 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0618  ISxcd1 transposase  28.95 
 
 		 266 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3364  ISxcd1 transposase  28.95 
 
 		 266 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2897  ISxcd1 transposase  28.07 
 
 		 209 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0637  transposase OrfB  24.56 
 
 		 249 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.417638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0640  transposase OrfB  24.56 
 
 		 249 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.263209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0849  transposase OrfB  24.56 
 
 		 249 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553346 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1439  ISRSO12-transposase ORFB protein  32.47 
 
 		 234 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2706  ISRSO12-transposase ORFB protein  32.47 
 
 		 234 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.147887 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0504  ISRSO12-transposase ORFB protein  32.47 
 
 		 234 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2509  integrase  35.53 
 
 		 231 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0263754 
 
 
-
 
NC_003296  RS05623  transposase  32.47 
 
 		 305 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1303  transposase  32.47 
 
 		 305 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  33.33 
 
 		 284 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  28.95 
 
 		 269 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  28.95 
 
 		 269 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  28.95 
 
 		 269 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  28.95 
 
 		 269 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1628  ISRSO16-transposase ORFB protein  25 
 
 		 269 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  23.68 
 
 		 280 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  30.26 
 
 		 273 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1827  hypothetical protein  41.18 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3557  hypothetical protein  41.18 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4005  Integrase catalytic region  32 
 
 		 281 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795108  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1112  integrase, catalytic region  30.26 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.329084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  30.67 
 
 		 260 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  26.32 
 
 		 273 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  26.32 
 
 		 273 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  26.32 
 
 		 273 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1671  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1472  integrase catalytic subunit  30.67 
 
 		 242 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.773509  normal  0.0414542 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1492  integrase catalytic subunit  30.67 
 
 		 242 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275235 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1504  integrase catalytic subunit  30.67 
 
 		 242 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1944  integrase catalytic subunit  30.67 
 
 		 242 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 250 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 250 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 250 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 250 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 250 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 250 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 250 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 250 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 250 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 250 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1490  Integrase catalytic region  30.67 
 
 		 284 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00848161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1155  Integrase catalytic region  30.67 
 
 		 284 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.667808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1027  Integrase catalytic region  30.67 
 
 		 284 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 345 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 345 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 345 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 345 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 358 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 345 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 345 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 345 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 345 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>