23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4338 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4338    100 
 
 		 619 bp  1227    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    88.64 
 
 		 1142 bp  644    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  88.59 
 
 		 837 bp  648    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1289    89.61 
 
 		 858 bp  708    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  87.97 
 
 		 837 bp  603  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4219    87.18 
 
 		 839 bp  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  88.66 
 
 		 753 bp  561  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  87.15 
 
 		 837 bp  563  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4717    86.9 
 
 		 821 bp  525  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3677    86.75 
 
 		 728 bp  486  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  86.59 
 
 		 753 bp  482  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  86.16 
 
 		 756 bp  458  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8384  hypothetical protein  91.11 
 
 		 405 bp  345  9e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0441  putative insertion element protein  88.25 
 
 		 336 bp  327  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0170    85.45 
 
 		 249 bp  182  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0366514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0226  hypothetical protein  81.6 
 
 		 351 bp  111  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  84.62 
 
 		 831 bp  109  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2815    86.44 
 
 		 240 bp  107  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  90.91 
 
 		 852 bp  56  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  92.11 
 
 		 723 bp  52  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  92.11 
 
 		 723 bp  52  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  92.11 
 
 		 723 bp  52  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4913  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 		 2223 bp  48.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0991334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>