16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0170 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0170    100 
 
 		 249 bp  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0366514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0226  hypothetical protein  93.78 
 
 		 351 bp  335  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    87.26 
 
 		 1142 bp  206  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  87.26 
 
 		 837 bp  206  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  86.32 
 
 		 753 bp  190  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4338    85.45 
 
 		 619 bp  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  84.29 
 
 		 837 bp  155  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1289    83.49 
 
 		 858 bp  143  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  83.49 
 
 		 756 bp  143  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  82.86 
 
 		 837 bp  131  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3677    82.08 
 
 		 728 bp  119  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  83.65 
 
 		 753 bp  109  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4717    81.28 
 
 		 821 bp  109  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4219    84.67 
 
 		 839 bp  105  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2815    93.94 
 
 		 240 bp  50.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  100 
 
 		 1185 bp  46.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>