29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1130 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1130    100 
 
 		 183 bp  363  1e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  96.72 
 
 		 837 bp  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1038    96.72 
 
 		 183 bp  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0151  hypothetical protein  95.63 
 
 		 216 bp  299  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  95.63 
 
 		 756 bp  299  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  95.63 
 
 		 837 bp  299  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0107  hypothetical protein  95.63 
 
 		 216 bp  299  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0568    93.71 
 
 		 159 bp  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0794854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1091    95.24 
 
 		 150 bp  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0535  hypothetical protein  90.06 
 
 		 309 bp  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4009    90 
 
 		 180 bp  214  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.223368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4219    89.83 
 
 		 839 bp  208  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4225    88.33 
 
 		 189 bp  190  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0104    94.87 
 
 		 204 bp  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3972    96.04 
 
 		 150 bp  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4342    94.57 
 
 		 225 bp  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0351    85 
 
 		 1142 bp  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  85 
 
 		 837 bp  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3976    85.63 
 
 		 171 bp  141  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4717    89.66 
 
 		 821 bp  135  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  84.44 
 
 		 753 bp  135  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5442    84.44 
 
 		 189 bp  135  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1508    85.91 
 
 		 204 bp  129  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4830    85.9 
 
 		 167 bp  127  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1289    84.76 
 
 		 858 bp  127  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3677    85.33 
 
 		 728 bp  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  81.21 
 
 		 753 bp  81.8  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2815    82.11 
 
 		 240 bp  69.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0797  hypothetical protein  93.75 
 
 		 162 bp  48.1  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0461181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>