More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2497 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2497  inner-membrane translocator  100 
 
 		 317 aa  609  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106211  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01987  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  39.93 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  32.4 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0512  inner-membrane translocator  30.52 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0951798  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  34.55 
 
 		 603 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3795  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189427 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3908  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2142  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 324 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  28.66 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.52 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1097  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.701299  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  29.84 
 
 		 415 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1828  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000769607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0143  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0801  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 282 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  29.14 
 
 		 334 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0908  inner-membrane translocator  35 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.579851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  33.71 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0328  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 325 aa  102  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.286891  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1906  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 326 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1100  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 343 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0111942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3398  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 335 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0288037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5640  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2128  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  33.68 
 
 		 593 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 318 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 313 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 381 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.88 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7433  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  31.69 
 
 		 363 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1602  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 336 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.47347  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 398 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  30.51 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3966  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  29.3 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.03 
 
 		 646 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.21 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2266  inner-membrane translocator  30.22 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0901269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  34.92 
 
 		 608 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1135  inner-membrane translocator  31.42 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1950  inner-membrane translocator  30.51 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  29.35 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.79 
 
 		 326 aa  93.6  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  31.42 
 
 		 341 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1140  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 328 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  30.04 
 
 		 357 aa  92.8  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 646 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  29.89 
 
 		 324 aa  92.4  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1398  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6137  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 352 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0504355  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0006  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  hitchhiker  0.0000215345 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5535  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  hitchhiker  0.00000782274 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 359 aa  90.9  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1708  inner-membrane translocator  28.91 
 
 		 348 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550604  normal  0.0112984 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.52 
 
 		 609 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  34.04 
 
 		 611 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  30.32 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2203  inner-membrane translocator  31.5 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0794  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.605525  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3828  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.21 
 
 		 307 aa  90.5  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 633 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 339 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2919  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 332 aa  89.7  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  29.58 
 
 		 603 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.16 
 
 		 333 aa  89.7  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1821  inner-membrane translocator  32.05 
 
 		 328 aa  89.4  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1839  inner-membrane translocator  28.71 
 
 		 350 aa  89.4  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  27.12 
 
 		 616 aa  89.4  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 328 aa  89.4  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  33.77 
 
 		 852 aa  89  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  27.9 
 
 		 326 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2587  inner-membrane translocator  28.06 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629922  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  35 
 
 		 358 aa  88.6  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1437  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 368 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1532  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 368 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.378741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  29.22 
 
 		 562 aa  88.2  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  30.71 
 
 		 353 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  28.08 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 326 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>