More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5381 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_5381  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
574 aa  1138    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.643049  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2227  AMP-dependent synthetase and ligase  51.54 
 
 
564 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08014  normal  0.204171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 
561 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0254  AMP-dependent synthetase and ligase  48.84 
 
 
567 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0249162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7073  putative pimeloyl-CoA ligase pimA  48.52 
 
 
553 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3552  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 
550 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4237  dicarboxylate/CoA ligase PimA  49.07 
 
 
552 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3792  AMP-dependent synthetase and ligase  37.32 
 
 
571 aa  343  5e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 
564 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.45 
 
 
561 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.45 
 
 
582 aa  335  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 
566 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 
554 aa  334  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.28 
 
 
561 aa  333  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 
557 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.51 
 
 
561 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.28 
 
 
563 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.28 
 
 
563 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.28 
 
 
582 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.28 
 
 
563 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.28 
 
 
563 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.45 
 
 
561 aa  330  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 
551 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0169  AMP-dependent synthetase and ligase  39.57 
 
 
554 aa  327  3e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.38937  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 
549 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 
561 aa  323  7e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 
561 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 
565 aa  322  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 
559 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  33.7 
 
 
569 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  33.63 
 
 
543 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
539 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5859  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 
567 aa  303  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  34.59 
 
 
577 aa  302  9e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 
549 aa  302  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 
512 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 
591 aa  296  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 
549 aa  296  9e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 
590 aa  296  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 
564 aa  295  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 
578 aa  293  7e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 
544 aa  292  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  33.57 
 
 
577 aa  291  2e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  36.16 
 
 
521 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 
499 aa  286  5e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.43 
 
 
585 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 
577 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 
577 aa  280  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 
579 aa  281  3e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 
573 aa  280  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  33.1 
 
 
561 aa  280  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 
583 aa  280  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.59 
 
 
583 aa  280  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 
584 aa  280  7e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3249  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 
572 aa  280  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0843615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  32.47 
 
 
561 aa  279  9e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.47 
 
 
561 aa  279  9e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  32.47 
 
 
561 aa  279  9e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.47 
 
 
561 aa  279  9e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.47 
 
 
561 aa  279  9e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.47 
 
 
561 aa  279  9e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.29 
 
 
561 aa  279  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3836  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.49 
 
 
562 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 
583 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0946  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 
559 aa  276  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4098  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.64 
 
 
562 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.04 
 
 
561 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.04 
 
 
561 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.04 
 
 
561 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.04 
 
 
561 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.04 
 
 
561 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  31.07 
 
 
583 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1593  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.44 
 
 
558 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  33.39 
 
 
560 aa  273  8.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 
569 aa  270  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.58 
 
 
514 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1323  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.04 
 
 
561 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2551  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 
559 aa  269  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.083055  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 
559 aa  269  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.15 
 
 
513 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 
559 aa  268  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.93 
 
 
512 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0735  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.87 
 
 
560 aa  267  4e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.465816  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0069  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 
647 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 
584 aa  266  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4074  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.38 
 
 
561 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2857  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.78 
 
 
569 aa  266  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 
560 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  32.91 
 
 
551 aa  264  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 
569 aa  263  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 
662 aa  263  6.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.07 
 
 
572 aa  263  6.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 
536 aa  263  8.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0289  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.07 
 
 
554 aa  262  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 
510 aa  262  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0303  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.07 
 
 
581 aa  262  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1344  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.46 
 
 
572 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0144  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.2 
 
 
566 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.02 
 
 
562 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.697994  normal  0.273492 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
490 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>