224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3190 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3190  thymidine phosphorylase  100 
 
 		 436 aa  853    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.728246  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2964  thymidine phosphorylase  97.48 
 
 		 436 aa  751    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.277231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3146  thymidine phosphorylase  86.01 
 
 		 436 aa  676    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3923  thymidine phosphorylase  74.19 
 
 		 442 aa  529  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827993  normal  0.360079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1591  thymidine phosphorylase  63.49 
 
 		 438 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6240  thymidine phosphorylase  63.49 
 
 		 438 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683278  normal  0.643776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3657  thymidine phosphorylase  62.95 
 
 		 438 aa  491  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2865  thymidine phosphorylase  57.51 
 
 		 446 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6660  thymidine phosphorylase  61.87 
 
 		 438 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0180706  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6716  thymidine phosphorylase  63.02 
 
 		 438 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2821  thymidine phosphorylase  57.11 
 
 		 443 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.103126  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1026  thymidine phosphorylase  56.64 
 
 		 443 aa  487  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.890001  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1003  thymidine phosphorylase  58.04 
 
 		 443 aa  487  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.028852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3548  thymidine phosphorylase  56.41 
 
 		 443 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0580318  hitchhiker  0.0000567233 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002630  thymidine phosphorylase  56.71 
 
 		 442 aa  482  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.957831  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0974  thymidine phosphorylase  57.58 
 
 		 443 aa  482  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.290566  hitchhiker  0.00118059 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3047  thymidine phosphorylase  56.64 
 
 		 443 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184522  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0542  thymidine phosphorylase  55.94 
 
 		 440 aa  480  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.492482  normal  0.113052 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3377  thymidine phosphorylase  57.11 
 
 		 443 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000359678  hitchhiker  0.00317006 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1038  thymidine phosphorylase  55.94 
 
 		 443 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101588  hitchhiker  0.00000000837764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1103  thymidine phosphorylase  55.94 
 
 		 443 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  hitchhiker  0.000305013 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0661  thymidine phosphorylase  56.39 
 
 		 440 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3226  thymidine phosphorylase  56.41 
 
 		 443 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.547221  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2814  thymidine phosphorylase  57.81 
 
 		 443 aa  477  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000364581  unclonable  0.00000355939 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4983  thymidine phosphorylase  56.16 
 
 		 440 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4924  thymidine phosphorylase  56.16 
 
 		 440 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0600  thymidine phosphorylase  56.85 
 
 		 442 aa  478  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1141  thymidine phosphorylase  56.41 
 
 		 443 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000198917 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03376  thymidine phosphorylase  56.48 
 
 		 452 aa  477  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4976  thymidine phosphorylase  56.16 
 
 		 440 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0822  thymidine phosphorylase  56.62 
 
 		 442 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04258  thymidine phosphorylase  56.39 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3616  thymidine phosphorylase  56.39 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3674  thymidine phosphorylase  56.39 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.104507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1218  thymidine phosphorylase  55.01 
 
 		 443 aa  471  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4931  thymidine phosphorylase  56.39 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3365  thymidine phosphorylase  56.18 
 
 		 443 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.604066  hitchhiker  0.00212197 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04224  hypothetical protein  56.39 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.894595  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4981  thymidine phosphorylase  56.39 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4617  thymidine phosphorylase  56.39 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4929  thymidine phosphorylase  56.39 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3229  thymidine phosphorylase  56.41 
 
 		 443 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0875906  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4822  thymidine phosphorylase  55.71 
 
 		 440 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4890  thymidine phosphorylase  55.94 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00649353  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5897  thymidine phosphorylase  56.39 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3332  thymidine phosphorylase  56.39 
 
 		 444 aa  471  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0265  thymidine phosphorylase  60.56 
 
 		 439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3626  thymidine phosphorylase  55.94 
 
 		 440 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3497  thymidine phosphorylase  55.94 
 
 		 440 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0830  thymidine phosphorylase  55.96 
 
 		 471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1042  thymidine phosphorylase  55.71 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429173  hitchhiker  0.000000248089 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1928  thymidine phosphorylase  58.29 
 
 		 475 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.939437  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3451  thymidine phosphorylase  55.25 
 
 		 443 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4465  thymidine phosphorylase  60.94 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173869  normal  0.54283 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0620  thymidine phosphorylase  55.94 
 
 		 443 aa  451  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1970  thymidine phosphorylase  53.41 
 
 		 438 aa  448  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4177  thymidine phosphorylase  59.22 
 
 		 435 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0114  thymidine phosphorylase  60.09 
 
 		 440 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.277805  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1066  thymidine phosphorylase  60.09 
 
 		 440 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0412  thymidine phosphorylase  60.56 
 
 		 440 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.052188  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1276  thymidine phosphorylase  60.09 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2662  thymidine phosphorylase  60.09 
 
 		 440 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0136  thymidine phosphorylase  60.09 
 
 		 440 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.751059  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2806  thymidine phosphorylase  60.56 
 
 		 440 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.529241  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3342  thymidine phosphorylase  58.06 
 
 		 438 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0276  thymidine phosphorylase  56.59 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.57515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2986  thymidine phosphorylase  53.19 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1595  thymidine phosphorylase  56.35 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0248  thymidine phosphorylase  56.35 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.363539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0828  thymidine phosphorylase  57.28 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.61021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0830  thymidine phosphorylase  52.01 
 
 		 462 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1571  thymidine phosphorylase  52.68 
 
 		 434 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2222  thymidine phosphorylase  55.9 
 
 		 430 aa  359  6e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1625  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.03 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6093  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.53 
 
 		 438 aa  345  7e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0759218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.96 
 
 		 435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.96 
 
 		 435 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0662  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.46 
 
 		 434 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.132104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0617  thymidine phosphorylase  51.44 
 
 		 435 aa  325  7e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.640469  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.37 
 
 		 441 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  41.53 
 
 		 434 aa  316  5e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.69 
 
 		 431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  43.95 
 
 		 435 aa  305  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  44.39 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.54 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.28 
 
 		 446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2172  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.43 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  42.21 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2210  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.43 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.1 
 
 		 582 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.35 
 
 		 434 aa  301  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6449  thymidine phosphorylase  43.19 
 
 		 424 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1754  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.09 
 
 		 433 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169733  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.05 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.71 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.89 
 
 		 434 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.89 
 
 		 434 aa  299  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.64 
 
 		 434 aa  298  9e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.64 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2004  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  39.63 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>