224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1026 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1218  thymidine phosphorylase  84.88 
 
 		 443 aa  775    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3229  thymidine phosphorylase  86.23 
 
 		 443 aa  767    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0875906  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3377  thymidine phosphorylase  84.42 
 
 		 443 aa  745    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000359678  hitchhiker  0.00317006 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3047  thymidine phosphorylase  83.07 
 
 		 443 aa  744    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184522  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1026  thymidine phosphorylase  100 
 
 		 443 aa  904    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.890001  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1038  thymidine phosphorylase  86 
 
 		 443 aa  785    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101588  hitchhiker  0.00000000837764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1103  thymidine phosphorylase  85.78 
 
 		 443 aa  784    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  hitchhiker  0.000305013 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1003  thymidine phosphorylase  86.68 
 
 		 443 aa  780    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.028852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3548  thymidine phosphorylase  85.33 
 
 		 443 aa  773    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0580318  hitchhiker  0.0000567233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1042  thymidine phosphorylase  85.1 
 
 		 443 aa  764    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429173  hitchhiker  0.000000248089 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0974  thymidine phosphorylase  83.75 
 
 		 443 aa  753    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.290566  hitchhiker  0.00118059 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3365  thymidine phosphorylase  86.23 
 
 		 443 aa  767    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.604066  hitchhiker  0.00212197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3226  thymidine phosphorylase  86 
 
 		 443 aa  762    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.547221  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2814  thymidine phosphorylase  84.2 
 
 		 443 aa  751    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000364581  unclonable  0.00000355939 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1141  thymidine phosphorylase  86 
 
 		 443 aa  764    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000198917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2821  thymidine phosphorylase  86.68 
 
 		 443 aa  789    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.103126  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0620  thymidine phosphorylase  68.4 
 
 		 443 aa  618  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3626  thymidine phosphorylase  67.58 
 
 		 440 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0661  thymidine phosphorylase  66.89 
 
 		 440 aa  614  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3497  thymidine phosphorylase  67.58 
 
 		 440 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002630  thymidine phosphorylase  66.59 
 
 		 442 aa  614  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.957831  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03376  thymidine phosphorylase  66.82 
 
 		 452 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0830  thymidine phosphorylase  67.12 
 
 		 471 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2865  thymidine phosphorylase  66.67 
 
 		 446 aa  609  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0600  thymidine phosphorylase  65.23 
 
 		 442 aa  605  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0822  thymidine phosphorylase  64.61 
 
 		 442 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04258  thymidine phosphorylase  65.75 
 
 		 440 aa  597  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3616  thymidine phosphorylase  65.75 
 
 		 440 aa  598  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4981  thymidine phosphorylase  65.75 
 
 		 440 aa  597  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4931  thymidine phosphorylase  65.75 
 
 		 440 aa  597  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3674  thymidine phosphorylase  65.75 
 
 		 440 aa  597  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.104507 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3332  thymidine phosphorylase  64.03 
 
 		 444 aa  601  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4929  thymidine phosphorylase  65.75 
 
 		 440 aa  597  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5897  thymidine phosphorylase  65.75 
 
 		 440 aa  597  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0542  thymidine phosphorylase  63.93 
 
 		 440 aa  601  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.492482  normal  0.113052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04224  hypothetical protein  65.75 
 
 		 440 aa  597  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.894595  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4983  thymidine phosphorylase  65.3 
 
 		 440 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4617  thymidine phosphorylase  65.53 
 
 		 440 aa  596  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3451  thymidine phosphorylase  63.21 
 
 		 443 aa  594  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4924  thymidine phosphorylase  65.3 
 
 		 440 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4890  thymidine phosphorylase  65.3 
 
 		 440 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00649353  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4976  thymidine phosphorylase  65.07 
 
 		 440 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4822  thymidine phosphorylase  65.07 
 
 		 440 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1928  thymidine phosphorylase  66.37 
 
 		 475 aa  592  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.939437  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6660  thymidine phosphorylase  63.66 
 
 		 438 aa  519  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0180706  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1591  thymidine phosphorylase  62.41 
 
 		 438 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6240  thymidine phosphorylase  62.41 
 
 		 438 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683278  normal  0.643776 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6716  thymidine phosphorylase  59.82 
 
 		 438 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3657  thymidine phosphorylase  57.68 
 
 		 438 aa  489  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0114  thymidine phosphorylase  58.12 
 
 		 440 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.277805  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1066  thymidine phosphorylase  58.12 
 
 		 440 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1276  thymidine phosphorylase  58.12 
 
 		 443 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2662  thymidine phosphorylase  58.12 
 
 		 440 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0136  thymidine phosphorylase  58.12 
 
 		 440 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.751059  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0412  thymidine phosphorylase  60.7 
 
 		 440 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.052188  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2806  thymidine phosphorylase  57.89 
 
 		 440 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.529241  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3190  thymidine phosphorylase  56.64 
 
 		 436 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.728246  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0265  thymidine phosphorylase  55.69 
 
 		 439 aa  454  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3146  thymidine phosphorylase  57.82 
 
 		 436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1970  thymidine phosphorylase  51.15 
 
 		 438 aa  440  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2964  thymidine phosphorylase  56.64 
 
 		 436 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.277231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4465  thymidine phosphorylase  53.12 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173869  normal  0.54283 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0830  thymidine phosphorylase  54.48 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4177  thymidine phosphorylase  54.02 
 
 		 435 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3342  thymidine phosphorylase  52.89 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3923  thymidine phosphorylase  57.66 
 
 		 442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827993  normal  0.360079 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2986  thymidine phosphorylase  48.17 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1595  thymidine phosphorylase  49.66 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0248  thymidine phosphorylase  49.66 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.363539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0276  thymidine phosphorylase  48.74 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.57515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0828  thymidine phosphorylase  51 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.61021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2222  thymidine phosphorylase  50.63 
 
 		 430 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1571  thymidine phosphorylase  44.37 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42 
 
 		 441 aa  331  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1625  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.31 
 
 		 437 aa  330  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  43.91 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.59 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.52 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  41.61 
 
 		 434 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1977  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.32 
 
 		 433 aa  319  5e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1705  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.32 
 
 		 433 aa  319  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2004  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.32 
 
 		 433 aa  319  5e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3449  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.32 
 
 		 433 aa  319  5e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0452293  hitchhiker  9.91695e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.32 
 
 		 434 aa  318  9e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1897  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.32 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000548599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1756  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.32 
 
 		 433 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.212389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1734  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.07 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000258964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1894  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.32 
 
 		 433 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000430221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1929  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.32 
 
 		 433 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03249e-46 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1754  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.32 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169733  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6093  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.58 
 
 		 438 aa  316  6e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0759218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.47 
 
 		 439 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.55 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.08 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.08 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.08 
 
 		 434 aa  312  9e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.08 
 
 		 434 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.08 
 
 		 434 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.08 
 
 		 434 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.33 
 
 		 434 aa  312  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>