More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02825 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02825  transcriptional regulator, AsnC family protein  100 
 
 		 113 aa  226  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263598  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  92.04 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 164 aa  97.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 157 aa  97.4  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 159 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  42.73 
 
 		 229 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  41.82 
 
 		 175 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  41.82 
 
 		 175 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  41.82 
 
 		 175 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  41.82 
 
 		 175 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 202 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  41.82 
 
 		 229 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 202 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0133  helix-turn-helix, Fis-type  38.74 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 162 aa  94  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  40.19 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  38.39 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 156 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  38.74 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2859  AsnC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 156 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 157 aa  90.5  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 156 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 155 aa  90.1  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  35.71 
 
 		 156 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 156 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1090  AsnC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 156 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  39.09 
 
 		 169 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4315  AsnC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 156 aa  88.6  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169505  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1090  AsnC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 156 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.540988  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 175 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 169 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1180  AsnC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0727  AsnC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1508  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0615903  normal  0.388273 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1207  AsnC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1404  transcriptional regulator, AsnC family  39.09 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2096  AsnC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 		 175 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 175 aa  87.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.18 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  43.64 
 
 		 161 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 161 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 282 aa  87.4  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 198 aa  87.4  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 181 aa  87  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 198 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 198 aa  86.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03485  regulatory protein, AsnC/Lrp  39.09 
 
 		 160 aa  86.7  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  35.45 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1780  AsnC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152537  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1179  AsnC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.876809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.78 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2001  transcriptional regulator, AsnC family  37.38 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  35.45 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1694  transcriptional regulator, AsnC family  37.38 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.849273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  84.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 213 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0110  AsnC family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.655072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6107  AsnC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.352577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1883  AsnC family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>