More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0268 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
334 aa  664    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.142528  normal  0.163523 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.16 
 
 
343 aa  426  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01760  carbohydrate ABC transporter membrane protein  64.74 
 
 
329 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.9 
 
 
329 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.58 
 
 
347 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56 
 
 
320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.604651  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2338  ABC-type glucosylglycerol transport system permease protein  54.8 
 
 
328 aa  325  5e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.379248  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.23 
 
 
325 aa  316  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000235602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.44 
 
 
350 aa  315  5e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252536  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.74 
 
 
358 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463035  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7165  ABC alpha-glucoside transporter inner membrane binding protein  57.04 
 
 
323 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0234886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.86 
 
 
335 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.281814  normal  0.0722986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.78 
 
 
378 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.845135  hitchhiker  0.00000439381 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.53 
 
 
289 aa  259  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000851926  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.32 
 
 
289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.99 
 
 
336 aa  252  8.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.275951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0786  ABC transporter membrane spanning protein  47 
 
 
343 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.42 
 
 
346 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1651  inner membrane ABC transporter permease protein  45.96 
 
 
334 aa  236  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0167176  hitchhiker  0.00000136024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.97 
 
 
325 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.984077  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2911  ABC alpha-glucoside transporter inner membrane binding protein  47.39 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.306248 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.96 
 
 
335 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0498492  normal  0.505135 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.58 
 
 
337 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.36183 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2872  ABC alpha-glucoside transporter, inner membrane subunit AglF  45.19 
 
 
330 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.51146  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.94 
 
 
337 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.684401  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1518  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.19 
 
 
330 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10648  normal  0.108237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.04 
 
 
360 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394661  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.19 
 
 
331 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.696982  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.99 
 
 
367 aa  217  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26140  permease component of ABC-type sugar transporter  35.74 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.33736  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
290 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  32.93 
 
 
287 aa  124  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.7 
 
 
294 aa  122  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2010  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  29.31 
 
 
318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360583  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3529  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.19 
 
 
311 aa  116  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.62 
 
 
291 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.99 
 
 
319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
290 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.2 
 
 
306 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  31.18 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.05 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156181  normal  0.0141251 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  30.13 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.49 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
319 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243677  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
306 aa  113  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.692762  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
301 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415177  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.95 
 
 
313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  30.85 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.16 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.31 
 
 
309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.62 
 
 
301 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.963791  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  29.02 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  28.43 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.79 
 
 
318 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15070  permease component of ABC-type sugar transporter  29.12 
 
 
311 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0771026  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.94 
 
 
306 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.83 
 
 
335 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  29.5 
 
 
300 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.55 
 
 
294 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  29.33 
 
 
293 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
309 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.33 
 
 
293 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.73 
 
 
320 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305055  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
289 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.96 
 
 
293 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5329  ABC transporter membrane spanning protein  30.43 
 
 
308 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2702  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.35 
 
 
299 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.482713 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
306 aa  106  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
294 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
307 aa  106  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.97 
 
 
291 aa  106  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1443  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.52 
 
 
303 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0903613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
296 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
330 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.817571  normal  0.701036 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.2 
 
 
305 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371496  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.75 
 
 
348 aa  105  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.519073 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
316 aa  105  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000245953 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  29.17 
 
 
321 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1261  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.76 
 
 
298 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.12 
 
 
312 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 
316 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.17 
 
 
317 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.82 
 
 
330 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.848651  normal  0.375032 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.37 
 
 
318 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.152531  normal  0.26367 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1059  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  26.48 
 
 
310 aa  104  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.86 
 
 
299 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.32 
 
 
307 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.372981  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1493  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  30.38 
 
 
319 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  25.17 
 
 
314 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103465  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
299 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.175132  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3468  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
321 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
308 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
279 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.983189  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.81 
 
 
320 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>