More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0181 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0181  chorismate synthase  100 
 
 		 399 aa  820    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1114  chorismate synthase  78.23 
 
 		 395 aa  652    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2640  chorismate synthase  79.04 
 
 		 415 aa  664    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2387  chorismate synthase  75.58 
 
 		 383 aa  606  9.999999999999999e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1434  chorismate synthase  74.29 
 
 		 383 aa  597  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  47.54 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  43.72 
 
 		 366 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  46.05 
 
 		 362 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  46.05 
 
 		 362 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  46.05 
 
 		 373 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  45.2 
 
 		 362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  45.38 
 
 		 355 aa  301  1e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  45.76 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  45.76 
 
 		 362 aa  299  5e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  44.38 
 
 		 358 aa  299  7e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  43.54 
 
 		 358 aa  295  8e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  44.54 
 
 		 363 aa  295  9e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  45.48 
 
 		 359 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  44.35 
 
 		 362 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  43.89 
 
 		 354 aa  293  3e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  45.2 
 
 		 370 aa  291  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  45.68 
 
 		 362 aa  290  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  41.83 
 
 		 360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  42.09 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  45.63 
 
 		 359 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  43.58 
 
 		 352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  44.38 
 
 		 364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  41.81 
 
 		 360 aa  285  9e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  44.29 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  44.92 
 
 		 362 aa  282  9e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  43.98 
 
 		 458 aa  281  1e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  41.29 
 
 		 365 aa  279  7e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  38.46 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  41.21 
 
 		 365 aa  276  3e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  40.73 
 
 		 365 aa  276  7e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  43.3 
 
 		 362 aa  275  8e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  40.73 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  41.64 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  44.66 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  41.29 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  43.7 
 
 		 361 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  42.7 
 
 		 369 aa  273  6e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  43.7 
 
 		 384 aa  272  6e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  43.54 
 
 		 356 aa  272  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  44.38 
 
 		 364 aa  270  2e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  42.78 
 
 		 384 aa  270  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  41.85 
 
 		 361 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  42.37 
 
 		 363 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02650  chorismate synthase, putative  40.32 
 
 		 421 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  43.37 
 
 		 442 aa  269  7e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  42.18 
 
 		 361 aa  269  8e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  42.46 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  41.85 
 
 		 368 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  42.22 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  35.83 
 
 		 373 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05731  chorismate synthase (Eurofung)  40.21 
 
 		 410 aa  262  6.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.430078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  41.85 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  41.57 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1873  chorismate synthase  43.27 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.485609 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  42.38 
 
 		 368 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  41.5 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  41.23 
 
 		 364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  41.23 
 
 		 364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  41.23 
 
 		 364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  41.23 
 
 		 364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90939  Chorismate synthase  42.19 
 
 		 377 aa  259  5.0000000000000005e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  41.23 
 
 		 364 aa  259  6e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  40.39 
 
 		 371 aa  259  8e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  41.83 
 
 		 370 aa  258  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  41.14 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  43.18 
 
 		 361 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0730  chorismate synthase  40.28 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  40.73 
 
 		 366 aa  256  4e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  40.78 
 
 		 365 aa  256  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  43.61 
 
 		 361 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  41.62 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  43.98 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  42.09 
 
 		 361 aa  253  3e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  42.42 
 
 		 361 aa  252  6e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  42.42 
 
 		 361 aa  252  6e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2588  chorismate synthase  42.58 
 
 		 364 aa  252  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  39.89 
 
 		 366 aa  253  6e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  42.42 
 
 		 361 aa  252  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  42.42 
 
 		 361 aa  252  6e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3017  chorismate synthase  41.74 
 
 		 364 aa  253  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503026  normal  0.557092 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  42.42 
 
 		 361 aa  252  6e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  42.42 
 
 		 361 aa  252  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2877  chorismate synthase  44.38 
 
 		 361 aa  252  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472598  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  42.74 
 
 		 361 aa  252  7e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  42.42 
 
 		 361 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  42.42 
 
 		 361 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  39.89 
 
 		 364 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  41.48 
 
 		 361 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  43.26 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2416  chorismate synthase  42.02 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  40.11 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1340  chorismate synthase  38.4 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  41.34 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  43.82 
 
 		 352 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  42.98 
 
 		 361 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>