227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3133 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2986  FAD dependent oxidoreductase  71.36 
 
 		 447 aa  654    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.193305  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3133  Malate dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 		 446 aa  906    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0428  FAD dependent oxidoreductase  73.77 
 
 		 470 aa  662    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106038  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0687  FAD dependent oxidoreductase  76.18 
 
 		 462 aa  699    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.261465  normal  0.13641 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3629  Malate dehydrogenase (acceptor)  45.5 
 
 		 455 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0497  Malate dehydrogenase (acceptor)  43.15 
 
 		 446 aa  355  1e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000529233  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1873  FAD dependent oxidoreductase  42.73 
 
 		 446 aa  349  4e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1506  malate dehydrogenase (acceptor)  39.1 
 
 		 498 aa  339  5e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1634  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  40.27 
 
 		 448 aa  334  2e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2603  FAD dependent oxidoreductase  41.22 
 
 		 463 aa  332  6e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0628  malate:quinone oxidoreductase  40.27 
 
 		 450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1243  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  41.03 
 
 		 451 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.69775  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0434  acetyltransferase  39.86 
 
 		 448 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.722721  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0416  malate:quinone oxidoreductase, putative  38.93 
 
 		 448 aa  311  1e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0117382  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0442  malate:quinone oxidoreductase, putative  38.48 
 
 		 448 aa  311  2e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0480  malate:quinone oxidoreductase  38.39 
 
 		 448 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1565  putative malate:quinone oxidoreductase  38.26 
 
 		 448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 400 aa  106  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  27.03 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0349  malate:quinone oxidoreductase  27.64 
 
 		 576 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0851  malate:quinone oxidoreductase  27.61 
 
 		 519 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2925  malate:quinone oxidoreductase  27.41 
 
 		 539 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2767  malate:quinone oxidoreductase  27.41 
 
 		 539 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2387  malate:quinone oxidoreductase  27.27 
 
 		 551 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0382746  normal  0.138947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2851  malate:quinone oxidoreductase  27.44 
 
 		 521 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944411  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2412  malate:quinone oxidoreductase  25.64 
 
 		 494 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1337  malate:quinone oxidoreductase  24.78 
 
 		 523 aa  94  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4141  malate:quinone oxidoreductase  26.1 
 
 		 545 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1279  malate:quinone oxidoreductase  26.1 
 
 		 545 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3915  malate:quinone oxidoreductase  24.08 
 
 		 545 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1251  malate:quinone oxidoreductase  25.79 
 
 		 545 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2825  malate:quinone oxidoreductase  24.29 
 
 		 527 aa  89.7  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0832763  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 400 aa  89.7  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02137  malate:quinone oxidoreductase  25.56 
 
 		 548 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1448  malate/quinone oxidoreductase  25.56 
 
 		 548 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2349  malate:quinone oxidoreductase  25.56 
 
 		 548 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3348  malate:quinone oxidoreductase  25.56 
 
 		 548 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02096  hypothetical protein  25.56 
 
 		 548 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2359  malate:quinone oxidoreductase  25.56 
 
 		 548 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2102  malate:quinone oxidoreductase  25.16 
 
 		 549 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.798564  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1438  malate:quinone oxidoreductase  23.27 
 
 		 527 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.520556  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1440  malate:quinone oxidoreductase  25.56 
 
 		 548 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.629978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2509  malate:quinone oxidoreductase  25.56 
 
 		 548 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0730  malate:quinone oxidoreductase  25.56 
 
 		 548 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2788  malate:quinone oxidoreductase  23.7 
 
 		 552 aa  88.2  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.772019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 407 aa  87.4  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  25.06 
 
 		 404 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0814  malate:quinone oxidoreductase  25.15 
 
 		 553 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00169357  normal  0.567964 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  25.72 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  25.96 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1661  malate:quinone oxidoreductase  25.11 
 
 		 526 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2950  malate:quinone oxidoreductase  25.08 
 
 		 553 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2189  malate:quinone oxidoreductase  24.5 
 
 		 501 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  24.69 
 
 		 625 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4340  malate:quinone oxidoreductase  26.27 
 
 		 571 aa  84.7  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4992  malate:quinone oxidoreductase  25.62 
 
 		 553 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293492  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3168  malate:quinone oxidoreductase  25.62 
 
 		 553 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2241  malate/quinone oxidoreductase  25.42 
 
 		 510 aa  84.7  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000570107  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1548  malate:quinone oxidoreductase  25.37 
 
 		 497 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4539  malate:quinone oxidoreductase  24.6 
 
 		 508 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  24.94 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1509  malate:quinone oxidoreductase  25.16 
 
 		 568 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0613705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1788  malate:quinone oxidoreductase  25.16 
 
 		 550 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0152962  normal  0.0435205 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4311  malate:quinone oxidoreductase  25.31 
 
 		 547 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141568  hitchhiker  0.00000172101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3251  malate:quinone oxidoreductase  25.7 
 
 		 547 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  25.48 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5100  malate:quinone oxidoreductase  25.7 
 
 		 560 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0172507  hitchhiker  0.0081168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1524  malate:quinone oxidoreductase  26.75 
 
 		 525 aa  82.4  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000801477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4052  malate:quinone oxidoreductase  25.28 
 
 		 518 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0001  malate:quinone oxidoreductase  22.37 
 
 		 507 aa  80.5  0.00000000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2601  malate:quinone oxidoreductase  24.78 
 
 		 540 aa  80.5  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636269  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12960  malate:quinone oxidoreductase  25.61 
 
 		 494 aa  80.1  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0120634  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2312  malate:quinone oxidoreductase  25.27 
 
 		 498 aa  79.7  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1509  malate:quinone oxidoreductase  24.72 
 
 		 550 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223394  normal  0.79888 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2579  malate:quinone oxidoreductase  28.12 
 
 		 508 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  24.03 
 
 		 412 aa  79.7  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3398  malate:quinone oxidoreductase  23.36 
 
 		 493 aa  79.7  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842885  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12867  malate:quinone oxidoreductase  25.72 
 
 		 493 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000016519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3677  malate:quinone oxidoreductase  24.68 
 
 		 498 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2142  malate:quinone oxidoreductase  24.49 
 
 		 519 aa  77.8  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19470  malate:quinone oxidoreductase  25.8 
 
 		 523 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1433  malate:quinone oxidoreductase  23.71 
 
 		 509 aa  77  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 399 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  27.25 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  24.23 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1675  malate:quinone oxidoreductase  25.8 
 
 		 523 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0381  malate:quinone oxidoreductase  24.15 
 
 		 498 aa  76.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0155844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1753  malate:quinone oxidoreductase  22.44 
 
 		 500 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2679  malate/quinone oxidoreductase  24.15 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0628359 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  25.12 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3093  malate:quinone oxidoreductase  23.21 
 
 		 561 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.397508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2378  malate:quinone oxidoreductase  23.41 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2135  malate:quinone oxidoreductase  23.44 
 
 		 500 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2168  malate:quinone oxidoreductase  24.56 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  22.71 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2300  malate:quinone oxidoreductase  25.28 
 
 		 518 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.671503  normal  0.184935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>