143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4539 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2341  malate:quinone oxidoreductase  67.67 
 
 
497 aa  709    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.286796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2378  malate:quinone oxidoreductase  69.11 
 
 
495 aa  726    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4539  malate:quinone oxidoreductase  100 
 
 
508 aa  1046    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2529  malate:quinone oxidoreductase  67.08 
 
 
497 aa  705    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.521046  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2679  malate/quinone oxidoreductase  65.33 
 
 
510 aa  689    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0628359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61400  malate:quinone oxidoreductase  60.2 
 
 
507 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.546459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5289  malate:quinone oxidoreductase  60.2 
 
 
507 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.283947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3677  malate:quinone oxidoreductase  60.04 
 
 
498 aa  619  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0381  malate:quinone oxidoreductase  60.16 
 
 
498 aa  619  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0155844  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0976  malate:quinone oxidoreductase  60 
 
 
502 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.984812  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04080  malate:quinone oxidoreductase  57.86 
 
 
539 aa  607  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00990069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1136  malate:quinone oxidoreductase  58.97 
 
 
502 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3994  malate:quinone oxidoreductase  57.14 
 
 
492 aa  604  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19470  malate:quinone oxidoreductase  57.63 
 
 
523 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1675  malate:quinone oxidoreductase  57.63 
 
 
523 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0792  malate:quinone oxidoreductase  57.69 
 
 
502 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0751  malate:quinone oxidoreductase  56.97 
 
 
502 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.209106  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0779  malate:quinone oxidoreductase  56.97 
 
 
502 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41330  malate:quinone oxidoreductase  56.39 
 
 
510 aa  585  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3093  malate:quinone oxidoreductase  57.23 
 
 
561 aa  586  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.397508  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1524  malate:quinone oxidoreductase  57.46 
 
 
525 aa  586  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000801477  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1661  malate:quinone oxidoreductase  55.31 
 
 
526 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.278374 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4438  malate:quinone oxidoreductase  57.03 
 
 
501 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1337  malate:quinone oxidoreductase  55.38 
 
 
523 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4724  malate:quinone oxidoreductase  55.85 
 
 
502 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3398  malate:quinone oxidoreductase  53.29 
 
 
493 aa  572  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2825  malate:quinone oxidoreductase  54.15 
 
 
527 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0832763  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2189  malate:quinone oxidoreductase  57.09 
 
 
501 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02137  malate:quinone oxidoreductase  54.45 
 
 
548 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1448  malate/quinone oxidoreductase  54.14 
 
 
548 aa  568  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02096  hypothetical protein  54.45 
 
 
548 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2349  malate:quinone oxidoreductase  54.45 
 
 
548 aa  569  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2509  malate:quinone oxidoreductase  54.45 
 
 
548 aa  569  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1440  malate:quinone oxidoreductase  54.45 
 
 
548 aa  569  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.629978 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0730  malate:quinone oxidoreductase  54.45 
 
 
548 aa  569  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2549  malate:quinone oxidoreductase  55.17 
 
 
501 aa  567  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00140506  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3348  malate:quinone oxidoreductase  54.25 
 
 
548 aa  567  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2601  malate:quinone oxidoreductase  55.15 
 
 
540 aa  566  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636269  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2359  malate:quinone oxidoreductase  54.05 
 
 
548 aa  566  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4255  malate:quinone oxidoreductase  54.85 
 
 
517 aa  564  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1433  malate:quinone oxidoreductase  55.26 
 
 
509 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1438  malate:quinone oxidoreductase  53.56 
 
 
527 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.520556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2286  malate:quinone oxidoreductase  54.97 
 
 
500 aa  562  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000345665 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0011  malate:quinone oxidoreductase  53.8 
 
 
492 aa  560  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2579  malate:quinone oxidoreductase  54.69 
 
 
508 aa  560  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4992  malate:quinone oxidoreductase  53.71 
 
 
553 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293492  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5100  malate:quinone oxidoreductase  53.71 
 
 
560 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0172507  hitchhiker  0.0081168 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3168  malate:quinone oxidoreductase  53.71 
 
 
553 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2135  malate:quinone oxidoreductase  56.47 
 
 
500 aa  561  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4311  malate:quinone oxidoreductase  53.71 
 
 
547 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141568  hitchhiker  0.00000172101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3251  malate:quinone oxidoreductase  53.71 
 
 
547 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1698  malate/quinone oxidoreductase  56.58 
 
 
498 aa  555  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0112426  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13020  malate:quinone-oxidoreductase  55.08 
 
 
499 aa  555  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2950  malate:quinone oxidoreductase  53.51 
 
 
553 aa  554  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3714  malate:quinone oxidoreductase  55.44 
 
 
493 aa  554  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.235648  normal  0.0237296 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2142  malate:quinone oxidoreductase  55.31 
 
 
519 aa  550  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0001  malate:quinone oxidoreductase  51.2 
 
 
507 aa  549  1e-155  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08440  malate:quinone oxidoreductase  52.54 
 
 
494 aa  546  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0563554  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2788  malate:quinone oxidoreductase  53.46 
 
 
552 aa  547  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.772019  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4862  malate:quinone oxidoreductase  52.52 
 
 
503 aa  548  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2102  malate:quinone oxidoreductase  52.41 
 
 
549 aa  544  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.798564  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2241  malate/quinone oxidoreductase  54.2 
 
 
510 aa  544  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000570107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2768  malate:quinone oxidoreductase  55.26 
 
 
500 aa  541  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940073  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1548  malate:quinone oxidoreductase  52.06 
 
 
497 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307133  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2925  malate:quinone oxidoreductase  52.41 
 
 
539 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1955  malate:quinone oxidoreductase  54.87 
 
 
492 aa  538  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2767  malate:quinone oxidoreductase  52.41 
 
 
539 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1251  malate:quinone oxidoreductase  52.13 
 
 
545 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3011  malate:quinone oxidoreductase  54.45 
 
 
500 aa  537  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0935347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2267  malate:quinone oxidoreductase  54.45 
 
 
500 aa  536  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2762  malate:quinone oxidoreductase  54.45 
 
 
500 aa  538  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2712  malate:quinone oxidoreductase  54.45 
 
 
500 aa  538  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00151177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2692  malate:quinone oxidoreductase  54.45 
 
 
500 aa  537  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2970  malate:quinone oxidoreductase  54.45 
 
 
500 aa  538  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000558132 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2974  malate:quinone oxidoreductase  54.45 
 
 
500 aa  538  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0643605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2389  malate:quinone oxidoreductase  52.64 
 
 
492 aa  536  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1279  malate:quinone oxidoreductase  52.13 
 
 
545 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2435  malate:quinone oxidoreductase  52.64 
 
 
492 aa  536  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2975  malate:quinone oxidoreductase  54.66 
 
 
500 aa  538  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3012  malate:quinone oxidoreductase  54.45 
 
 
500 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.153205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2851  malate:quinone oxidoreductase  52.1 
 
 
521 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944411  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4141  malate:quinone oxidoreductase  52.55 
 
 
545 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981966  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3915  malate:quinone oxidoreductase  52.13 
 
 
545 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0814  malate:quinone oxidoreductase  51.31 
 
 
553 aa  534  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00169357  normal  0.567964 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0851  malate:quinone oxidoreductase  52.72 
 
 
519 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2387  malate:quinone oxidoreductase  50.51 
 
 
551 aa  528  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0382746  normal  0.138947 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1166  malate:quinone oxidoreductase  51.91 
 
 
565 aa  529  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1616  malate:quinone oxidoreductase  51.65 
 
 
494 aa  530  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0349  malate:quinone oxidoreductase  53.09 
 
 
576 aa  529  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1915  malate:quinone oxidoreductase  52.33 
 
 
562 aa  530  1e-149  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0177221  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1853  malate:quinone oxidoreductase  52.13 
 
 
562 aa  528  1e-149  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3250  malate/quinone oxidoreductase  51.52 
 
 
497 aa  531  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1083  malate:quinone oxidoreductase  52.82 
 
 
566 aa  530  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.341711  normal  0.98769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2132  malate/quinone oxidoreductase  51.71 
 
 
508 aa  525  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0256265  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4340  malate:quinone oxidoreductase  53.28 
 
 
571 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2069  malate:quinone oxidoreductase  53.36 
 
 
516 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0761832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2115  malate:quinone oxidoreductase  53.36 
 
 
516 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.015183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1788  malate:quinone oxidoreductase  51.33 
 
 
550 aa  522  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0152962  normal  0.0435205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2052  malate:quinone oxidoreductase  53.36 
 
 
516 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4052  malate:quinone oxidoreductase  52.55 
 
 
518 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>