185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1506 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1506  malate dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 		 498 aa  1030    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0497  Malate dehydrogenase (acceptor)  60.85 
 
 		 446 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000529233  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0628  malate:quinone oxidoreductase  59.69 
 
 		 450 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1634  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  58.71 
 
 		 448 aa  553  1e-156  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0434  acetyltransferase  56.95 
 
 		 448 aa  530  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.722721  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1243  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  57.37 
 
 		 451 aa  520  1e-146  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.69775  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0442  malate:quinone oxidoreductase, putative  56.47 
 
 		 448 aa  511  1e-144  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0416  malate:quinone oxidoreductase, putative  56.03 
 
 		 448 aa  511  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1565  putative malate:quinone oxidoreductase  56.03 
 
 		 448 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0480  malate:quinone oxidoreductase  55.58 
 
 		 448 aa  495  1e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1873  FAD dependent oxidoreductase  54.91 
 
 		 446 aa  491  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3629  Malate dehydrogenase (acceptor)  49.78 
 
 		 455 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2603  FAD dependent oxidoreductase  46.5 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2986  FAD dependent oxidoreductase  40.58 
 
 		 447 aa  360  2e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.193305  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0687  FAD dependent oxidoreductase  40.5 
 
 		 462 aa  354  2e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.261465  normal  0.13641 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3133  Malate dehydrogenase (acceptor)  39.1 
 
 		 446 aa  339  5e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0428  FAD dependent oxidoreductase  40.27 
 
 		 470 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106038  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  24.83 
 
 		 404 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  23.68 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4539  malate:quinone oxidoreductase  24.03 
 
 		 508 aa  84  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  24.31 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  22.22 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  24.18 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2579  malate:quinone oxidoreductase  24.29 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  25.78 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2135  malate:quinone oxidoreductase  25.61 
 
 		 500 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  23.94 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2601  malate:quinone oxidoreductase  25.38 
 
 		 540 aa  80.5  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2241  malate/quinone oxidoreductase  24.06 
 
 		 510 aa  80.1  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000570107  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0349  malate:quinone oxidoreductase  24.41 
 
 		 576 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2312  malate:quinone oxidoreductase  25.69 
 
 		 498 aa  79.7  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  24.82 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1433  malate:quinone oxidoreductase  24.67 
 
 		 509 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  23.89 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2189  malate:quinone oxidoreductase  23.78 
 
 		 501 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  25.84 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4992  malate:quinone oxidoreductase  23.89 
 
 		 553 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293492  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3168  malate:quinone oxidoreductase  23.89 
 
 		 553 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1166  malate:quinone oxidoreductase  23.67 
 
 		 565 aa  77.4  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4052  malate:quinone oxidoreductase  24.55 
 
 		 518 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2529  malate:quinone oxidoreductase  25.36 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.521046  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4311  malate:quinone oxidoreductase  23.89 
 
 		 547 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141568  hitchhiker  0.00000172101 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5100  malate:quinone oxidoreductase  23.67 
 
 		 560 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0172507  hitchhiker  0.0081168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3251  malate:quinone oxidoreductase  23.67 
 
 		 547 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2975  malate:quinone oxidoreductase  25.56 
 
 		 500 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3398  malate:quinone oxidoreductase  24.44 
 
 		 493 aa  76.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842885  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  26.57 
 
 		 409 aa  76.3  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 408 aa  76.6  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2168  malate:quinone oxidoreductase  23.87 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  25.46 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41330  malate:quinone oxidoreductase  26.55 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2267  malate:quinone oxidoreductase  25.56 
 
 		 500 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2412  malate:quinone oxidoreductase  24.52 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  25.9 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3012  malate:quinone oxidoreductase  25.11 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.153205  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2925  malate:quinone oxidoreductase  23.61 
 
 		 539 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  24.89 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2762  malate:quinone oxidoreductase  25.11 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2712  malate:quinone oxidoreductase  25.11 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00151177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2692  malate:quinone oxidoreductase  25.11 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2950  malate:quinone oxidoreductase  23.67 
 
 		 553 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2974  malate:quinone oxidoreductase  25.11 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0643605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2970  malate:quinone oxidoreductase  25.11 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000558132 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3011  malate:quinone oxidoreductase  24.89 
 
 		 500 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0935347  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0797  malate:quinone oxidoreductase  24.34 
 
 		 512 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.64083  normal  0.0315045 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2768  malate:quinone oxidoreductase  25.33 
 
 		 500 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940073  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  24.07 
 
 		 625 aa  71.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2400  malate/quinone oxidoreductase  23.36 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514412  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  23.66 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  25.23 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2679  malate/quinone oxidoreductase  24.07 
 
 		 510 aa  70.5  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0628359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3714  malate:quinone oxidoreductase  25.11 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.235648  normal  0.0237296 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04171  malate:quinone oxidoreductase  24.17 
 
 		 500 aa  70.1  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.129432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1337  malate:quinone oxidoreductase  24.08 
 
 		 523 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66625  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1572  malate:quinone oxidoreductase  22.93 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  24.08 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  23.94 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1908  malate/quinone oxidoreductase  24.3 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.266658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  22.51 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2069  malate:quinone oxidoreductase  24.55 
 
 		 516 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0761832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2115  malate:quinone oxidoreductase  24.55 
 
 		 516 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.015183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2052  malate:quinone oxidoreductase  24.55 
 
 		 516 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  23.09 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0381  malate:quinone oxidoreductase  23.78 
 
 		 498 aa  68.2  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0155844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  23.49 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2300  malate:quinone oxidoreductase  24.5 
 
 		 518 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.671503  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2629  malate:quinone oxidoreductase  22.83 
 
 		 498 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.765647  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  25.23 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2683  malate:quinone oxidoreductase  22.83 
 
 		 498 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  22.99 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2788  malate:quinone oxidoreductase  22.72 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.772019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  22.03 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2378  malate:quinone oxidoreductase  23.43 
 
 		 495 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  21.38 
 
 		 400 aa  66.6  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>